43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2453 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2453  protein of unknown function DUF89  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000820322  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1577  hypothetical protein  87.46 
 
 		 307 aa  497  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000180014  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2857  protein of unknown function DUF89  83.39 
 
 		 297 aa  487  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1555  protein of unknown function DUF89  70.51 
 
 		 305 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502074  decreased coverage  0.0000247476 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0920  hypothetical protein  65.02 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2904  hypothetical protein  48.97 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0772  hypothetical protein  39.57 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0344375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0749  hypothetical protein  37.98 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.168528  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1536  hypothetical protein  32.99 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.637691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2876  protein of unknown function DUF89  35.66 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1580  hypothetical protein  37.28 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1030  protein of unknown function DUF89  35.87 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0811  hypothetical protein  37.23 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0236896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21010  hypothetical protein  32.19 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000259522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0605  protein of unknown function DUF89  34.53 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0338  hypothetical protein  32.13 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1861  hypothetical protein  31.11 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0170124  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3221  hypothetical protein  31.38 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1420  hypothetical protein  32.13 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.636478  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1644  protein of unknown function DUF89  36.59 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0499  hypothetical protein  31.48 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0567  hypothetical protein  30.13 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.584025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0388  hypothetical protein  34.56 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0602  hypothetical protein  27.89 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.058078  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0464  hypothetical protein  31.92 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0197521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0164  protein of unknown function DUF89  33.64 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1052  protein of unknown function DUF89  36.15 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0482406  normal  0.221954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0860  hypothetical protein  31.58 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1940  hypothetical protein  27.74 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.176501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0546  protein of unknown function DUF89  29.73 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1372  hypothetical protein  32.6 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0046  hypothetical protein  30.14 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1616  hypothetical protein  26.5 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2187  hypothetical protein  25.78 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0818  hypothetical protein  32.98 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0849  hypothetical protein  25.7 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125309  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0291  hypothetical protein  27.82 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2154  protein of unknown function DUF89  27.56 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0568  hypothetical protein  26.79 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.108249  hitchhiker  0.00320219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1558  hypothetical protein  24.8 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0250  hypothetical protein  26.92 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.540172  normal  0.258484 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1739  hypothetical protein  25.91 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.56613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1738  hypothetical protein  25.56 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.500184  hitchhiker  0.00181566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>