More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2426 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  63.43 
 
 		 224 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  62.83 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  58.74 
 
 		 227 aa  261  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  59.35 
 
 		 224 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  60.27 
 
 		 227 aa  238  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  58.1 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  47.39 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  48.34 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  47.89 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  46.85 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1160  dethiobiotin synthase  37.78 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  41.18 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  39.04 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.09 
 
 		 646 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  34.95 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  35.36 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  35.65 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  37.11 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  35.64 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  36.22 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  37.21 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  35.36 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  36.41 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  35.16 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 		 254 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  31.69 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  35.63 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  35.63 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  39.13 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  34.69 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  35.63 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  35.63 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  35.8 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  35.63 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  35.63 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  35.63 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  31.16 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  34.95 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  35.59 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  35.59 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  36.13 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  30.22 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  35.06 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  35.06 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  33.15 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  35.15 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 186 aa  95.1  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  34.88 
 
 		 210 aa  95.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  33.49 
 
 		 247 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  35.03 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  37.21 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  38.82 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  35.03 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  35.03 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  35.59 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  37.06 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  36.16 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  31.28 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  34.48 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  33.91 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  35.6 
 
 		 266 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  40.17 
 
 		 190 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  32.09 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  32.8 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1373  dithiobiotin synthetase  36.93 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.265061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  38.12 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.36 
 
 		 708 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  38.14 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  38.12 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  34.65 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  31.05 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  32.84 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  30.73 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  34.44 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  30.73 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  39.89 
 
 		 213 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  35.67 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  35.16 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  36.29 
 
 		 186 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  32.07 
 
 		 238 aa  88.6  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  30 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  30.85 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  29.94 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  30.51 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  39.44 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  29.94 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  30.51 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  32.16 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  37.06 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  33.9 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  36.31 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  40.46 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  32.21 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  33.18 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  29.94 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  33.67 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>