More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2409 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 
287 aa  591  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  72.98 
 
 
285 aa  434  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  71.73 
 
 
285 aa  427  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2808  ATP-NAD/AcoX kinase  72.24 
 
 
288 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2165  ATP-NAD/AcoX kinase  70.32 
 
 
285 aa  421  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  69.75 
 
 
286 aa  417  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2432  ATP-NAD/AcoX kinase  69.04 
 
 
285 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  38.87 
 
 
285 aa  205  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  39.64 
 
 
302 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  36.79 
 
 
288 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  38.65 
 
 
284 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  39 
 
 
260 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  35.25 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  37.5 
 
 
288 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  36.3 
 
 
285 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  38.52 
 
 
283 aa  178  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  36.97 
 
 
288 aa  178  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  37.02 
 
 
291 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  36.62 
 
 
288 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  34.77 
 
 
311 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.56 
 
 
315 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.56 
 
 
296 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  34.86 
 
 
285 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0718  NAD(+) kinase  37.01 
 
 
283 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.7 
 
 
296 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0983  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  42.41 
 
 
293 aa  175  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.709246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0731  NAD(+) kinase  42.24 
 
 
272 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.69 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.69 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.7 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  36.23 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  36.16 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0775  ATP-NAD/AcoX kinase  41.38 
 
 
282 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0146172  normal  0.735032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.39 
 
 
296 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.39 
 
 
296 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  35.11 
 
 
284 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.58 
 
 
295 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  40.95 
 
 
282 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  39.02 
 
 
296 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  40.52 
 
 
282 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  35.13 
 
 
288 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  35.76 
 
 
309 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  39.48 
 
 
286 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  37.41 
 
 
290 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  34.03 
 
 
290 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.79 
 
 
295 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0969  sugar kinase  35.17 
 
 
294 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.43035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.51 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.06 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  32.52 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04330  ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
294 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1770  ATP-NAD/AcoX kinase  41.44 
 
 
282 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  36.3 
 
 
278 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.19 
 
 
292 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000370492  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0629  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.08 
 
 
288 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.376086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0964  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.62 
 
 
298 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000412128  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0900  ATP-NAD/AcoX kinase  33.81 
 
 
294 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000200756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  33.7 
 
 
297 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0729  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.62 
 
 
298 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0279623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1049  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.43 
 
 
295 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0798943  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  36.07 
 
 
288 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.21 
 
 
309 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.21 
 
 
309 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  32.88 
 
 
286 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3331  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.93 
 
 
307 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000815034  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.21 
 
 
309 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.21 
 
 
292 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.51 
 
 
297 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  39.29 
 
 
316 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.83 
 
 
292 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.27 
 
 
293 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.4384500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.27 
 
 
293 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2707  ATP-NAD/AcoX kinase  33.1 
 
 
261 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0379  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.71 
 
 
294 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.520886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1333  ATP-NAD/AcoX kinase  40.91 
 
 
261 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1185  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.33 
 
 
566 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.303831  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0088  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.77 
 
 
566 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.96 
 
 
309 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.79 
 
 
309 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.96 
 
 
309 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2438  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.46 
 
 
292 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0669  ATP-NAD/AcoX kinase  34.13 
 
 
294 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.935643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1474  ATP-NAD/AcoX kinase  36.09 
 
 
316 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0152163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1108  ATP-NAD/AcoX kinase  34.78 
 
 
280 aa  156  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.06 
 
 
292 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000258302  normal  0.101663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1046  NAD(+) kinase  33.45 
 
 
285 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.96 
 
 
309 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3009  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.56 
 
 
292 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2898  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.56 
 
 
292 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2827  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.56 
 
 
292 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000328242  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2896  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.56 
 
 
292 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.72588  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1693  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.79 
 
 
294 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  32.51 
 
 
299 aa  155  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  31.45 
 
 
292 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.21 
 
 
309 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000702127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01131  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.47 
 
 
294 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2878  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.56 
 
 
292 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.126338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  36.67 
 
 
292 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3486  ATP-NAD/AcoX kinase  36.76 
 
 
268 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00826859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3408  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.6 
 
 
292 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.828222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>