More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2374 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  528  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.99 
 
 
223 aa  283  2e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
223 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.54 
 
 
223 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.68 
 
 
227 aa  202  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
238 aa  173  2e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
233 aa  152  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.23483e-07  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
242 aa  139  5e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
238 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 
239 aa  136  3e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
241 aa  131  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.2 
 
 
238 aa  131  1e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.07 
 
 
241 aa  127  2e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 
238 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
225 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
244 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  9.89308e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
271 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
238 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.644121  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
225 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
225 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
224 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.650904  normal  0.189896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
261 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2590  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 
236 aa  120  2e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 
241 aa  120  2e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
242 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
239 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.61938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
242 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
242 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
239 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
242 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
242 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
239 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  8.94376e-15 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
239 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59131e-44 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
239 aa  119  4e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.7 
 
 
239 aa  119  4e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
240 aa  119  4e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 
242 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 
242 aa  118  8e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
240 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
246 aa  117  1e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  37.37 
 
 
272 aa  118  1e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
239 aa  117  2e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3826  short chain dehydrogenase  29.26 
 
 
234 aa  117  2e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
264 aa  117  2e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
271 aa  116  4e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
242 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00246779  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
273 aa  115  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  4.06118e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
247 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
279 aa  114  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
276 aa  114  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
252 aa  114  2e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
241 aa  114  2e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
248 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.36 
 
 
238 aa  113  4e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 
286 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  2.00632e-05 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
306 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 
236 aa  112  7e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  31.09 
 
 
239 aa  111  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
283 aa  111  1e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
254 aa  111  1e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4069  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
239 aa  111  1e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 
278 aa  111  1e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.71 
 
 
243 aa  110  2e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
272 aa  110  2e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
242 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
262 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
239 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
239 aa  109  4e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
276 aa  109  4e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  2.24332e-12 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
273 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3351  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
242 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
243 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.47 
 
 
239 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
239 aa  108  7e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
234 aa  108  9e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
283 aa  108  9e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 
280 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.82 
 
 
243 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
273 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
259 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
274 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
280 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
282 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
273 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
274 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
245 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  31.09 
 
 
239 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
239 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
228 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0331408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
279 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  8.68521e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 
268 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 
270 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
314 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.03 
 
 
270 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
257 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
248 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 
291 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
249 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.88 
 
 
256 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
252 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>