More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2360 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.28 
 
 		 232 aa  359  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.39 
 
 		 233 aa  346  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  72.41 
 
 		 232 aa  334  7.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  67.97 
 
 		 231 aa  328  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  67.24 
 
 		 232 aa  321  7e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  67.81 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.85 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.95 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  50 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.09 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.22 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  47.14 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  37.22 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.1 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.39 
 
 		 227 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  39.91 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  38.76 
 
 		 209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  32.72 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  32.72 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  31.8 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  32.26 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  33.18 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  29.57 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 		 213 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  32.5 
 
 		 257 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  36.44 
 
 		 246 aa  91.7  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  33.33 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  42.52 
 
 		 126 aa  85.5  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  28.44 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  31.14 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.98 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  31.98 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  35.71 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  33.9 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  30.7 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  32.6 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  31.78 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.78 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  26.46 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  37.5 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  30.67 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  30.12 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  29.05 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  31.82 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  34.76 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  31.28 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.67 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  29.15 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  31.71 
 
 		 372 aa  68.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  28.57 
 
 		 300 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.83 
 
 		 328 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  32.91 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  31.13 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.97 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  25.23 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  25.23 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  26.09 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  26.09 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.52 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.45 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  32.32 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.33 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  31.79 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40.5 
 
 		 500 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  29.71 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  32.32 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  25.56 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  26.61 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  25.22 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  25.22 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  28.31 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  28.57 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>