More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2346 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 226 aa  472  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2720  beta-lactamase domain protein  66.04 
 
 		 213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.373354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0179  beta-lactamase domain-containing protein  68.4 
 
 		 213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  62.74 
 
 		 213 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  64.62 
 
 		 213 aa  288  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1997  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  62.44 
 
 		 215 aa  286  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  58.99 
 
 		 218 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  39.55 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.38 
 
 		 346 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  37.19 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.04 
 
 		 354 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.82 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.63 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.15 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  32.02 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  36.76 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 467 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  34.15 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 459 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  32.06 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 459 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  31.22 
 
 		 346 aa  98.6  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.54 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.46 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  30.24 
 
 		 346 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 464 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.67 
 
 		 472 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 		 459 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 		 459 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 459 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  32.38 
 
 		 459 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  31.05 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  29.38 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  29.7 
 
 		 345 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.18 
 
 		 471 aa  92  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31656  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.29 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.976065  normal  0.697857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  33.16 
 
 		 249 aa  92  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  29.82 
 
 		 258 aa  91.7  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 242 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  30.32 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.014491 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  33.71 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 470 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 		 467 aa  90.9  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 		 444 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.7 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 470 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 		 382 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  29.19 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  30.2 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  30.2 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  33.16 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 201 aa  89.4  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.44 
 
 		 256 aa  89  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  32.21 
 
 		 249 aa  88.6  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  36.41 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  29.34 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  32.64 
 
 		 249 aa  88.6  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.26 
 
 		 263 aa  88.2  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 203 aa  88.2  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  30.29 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 195 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1750  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.57 
 
 		 263 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  25.64 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  31.53 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 344 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 471 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 		 298 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 461 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  31.28 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  30.14 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 466 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  30.37 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.29 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  30.1 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2434  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 300 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1411  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 		 300 aa  85.9  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>