More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2338 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  100 
 
 		 277 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  47.45 
 
 		 289 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  47.12 
 
 		 288 aa  262  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  43.12 
 
 		 278 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.43 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  29.72 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  29.23 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  26.83 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  25.95 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  28.78 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.96 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.42 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.06 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.08 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  22.41 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.88 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  33.56 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 162 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.43 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.66 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  25.09 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  26.87 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.25 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.17 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  27.66 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  35.62 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  24.5 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.2 
 
 		 170 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.12 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.1 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30 
 
 		 152 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.2 
 
 		 170 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.22 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.1 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.56 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.94 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.29 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  30.87 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  25.43 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  26.16 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.17 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  23.38 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.33 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  25.45 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  24.64 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.58 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.71 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.34 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.5 
 
 		 147 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  28.37 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  28.28 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.97 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  23.65 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  22.77 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  29.45 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  32.65 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  28.22 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  27.45 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  33.57 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  27.97 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  28.97 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  23.16 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  27.45 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  23.59 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  31.08 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  27.85 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.17 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.06 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.07 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  24.67 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.33 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  23.83 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  26.8 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  31.91 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  30.82 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  30.67 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  30.25 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  27.66 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.95 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>