More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2316 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  67.21 
 
 		 254 aa  339  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  63.01 
 
 		 251 aa  317  7.999999999999999e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  61.54 
 
 		 252 aa  297  9e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  64.95 
 
 		 222 aa  279  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  53.41 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  54.75 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  43.78 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  43.78 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  44.13 
 
 		 262 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  45.75 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  44.03 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  44.07 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  44.13 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  44.21 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  40.31 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  42.86 
 
 		 273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  43.93 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.03 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  45.93 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  42.93 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  42.08 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  39.65 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  39.39 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  46.54 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  38.75 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  42.13 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  37.75 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.19 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  38.46 
 
 		 250 aa  161  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  42.17 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  41.23 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  39.3 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  38.89 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  38.36 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  40.27 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  40.76 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  36.21 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  37.34 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  32.1 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  40.17 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.55 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  38.5 
 
 		 240 aa  152  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  35.34 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  38.5 
 
 		 240 aa  152  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  37.86 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  39.09 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  43.69 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  47.42 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  40.65 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  39.46 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  37.26 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  39.64 
 
 		 263 aa  148  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  42.59 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  36.07 
 
 		 240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.26 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1687  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  44.12 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  43.12 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  43.96 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  34.82 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  37.97 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  35.81 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>