93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2288 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  70.29 
 
 		 177 aa  263  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  68 
 
 		 178 aa  258  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  59.8 
 
 		 210 aa  254  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  59.3 
 
 		 178 aa  234  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  55.68 
 
 		 188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  62.42 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  36.26 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  41.36 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  39.52 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  43.7 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  39.51 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  34.38 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  36.65 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3967  hypothetical protein  33.68 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4162  hypothetical protein  33.68 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4069  hypothetical protein  33.68 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4044  hypothetical protein  33.68 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3847  hypothetical protein  32.98 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0293  hypothetical protein  32.98 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3665  hypothetical protein  32.64 
 
 		 194 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.821634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  36.14 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  34.91 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  38.37 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3651  hypothetical protein  34.91 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0402  hypothetical protein  35.63 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0283  hypothetical protein  35.19 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  36.65 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3329  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  29.47 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  30 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  29.47 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  29.47 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  29.47 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  29.47 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.95 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  29.47 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  30.27 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  30.27 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  29.47 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  30.08 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  31.58 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  24.31 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  32.59 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  28.12 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  31.85 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  26.42 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  26.67 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  31.11 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  26.43 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  25.84 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  28.3 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  31.06 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  27.27 
 
 		 230 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  24.11 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  29.85 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  31.03 
 
 		 257 aa  44.7  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  31.5 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  23.27 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  27.87 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  27.95 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  28.36 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  28.28 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  28.28 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  30.22 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  27.43 
 
 		 191 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 196 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  27.34 
 
 		 189 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  30 
 
 		 231 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  29.25 
 
 		 185 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  32.95 
 
 		 230 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  24.66 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  27.34 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  27.97 
 
 		 299 aa  41.2  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>