More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2281 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  58.3 
 
 
290 aa  325  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  54.91 
 
 
279 aa  295  8e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  51.47 
 
 
283 aa  276  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  53.31 
 
 
291 aa  271  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  52.59 
 
 
291 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  46.9 
 
 
286 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 
298 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 
300 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  39.55 
 
 
305 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
303 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  38.62 
 
 
288 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  29.14 
 
 
311 aa  145  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
722 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
330 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
346 aa  142  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  36.55 
 
 
284 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
337 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  32.06 
 
 
320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  36.04 
 
 
838 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
342 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
340 aa  125  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
297 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
455 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
346 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
300 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  29.37 
 
 
338 aa  118  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
355 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
353 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  26.85 
 
 
342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
836 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
1267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
841 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 
313 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
1267 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
329 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
401 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  28.62 
 
 
358 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
299 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
822 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
320 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
344 aa  108  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  32.53 
 
 
348 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
317 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 
303 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
359 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
350 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
341 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
328 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  27.86 
 
 
330 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  28.34 
 
 
342 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
312 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
1340 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
318 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
308 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
331 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
679 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
319 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 
334 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
337 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
317 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
297 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
336 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
313 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
334 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
327 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
624 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
337 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
306 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  28.35 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 
325 aa  99  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
305 aa  98.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
334 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
994 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
703 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
319 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
332 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
313 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>