More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2229 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  423  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  87.08 
 
 		 209 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  83.73 
 
 		 209 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  81.34 
 
 		 209 aa  354  5e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  75.12 
 
 		 209 aa  334  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  72.73 
 
 		 209 aa  320  8e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  70.33 
 
 		 209 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  55.34 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  55.61 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  53.69 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 210 aa  214  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  48.06 
 
 		 222 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.99 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 205 aa  201  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  46.89 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  48.26 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 219 aa  195  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 208 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  46.12 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  45.89 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  45.63 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  45.41 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  47.24 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  45.15 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  47.29 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  43.54 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  46.57 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  44.23 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  48.19 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  47.2 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  0.00000985108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  46.04 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  45.05 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  45.05 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  43.78 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  45.36 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  48.26 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  45.92 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  43.27 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0192  ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  45.54 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  42.58 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  43.78 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  48.26 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>