More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2226 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  5.49007e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  93.56 
 
 
264 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  92.42 
 
 
264 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  91.29 
 
 
279 aa  468  1e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  82.95 
 
 
279 aa  457  1e-128  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  87.5 
 
 
279 aa  453  1e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.64134e-06  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  66.67 
 
 
277 aa  361  5e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  67.05 
 
 
275 aa  355  4e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  67.18 
 
 
276 aa  354  7e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  67.42 
 
 
275 aa  350  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  66.28 
 
 
274 aa  349  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  65.52 
 
 
275 aa  348  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  65.27 
 
 
276 aa  347  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  64.84 
 
 
275 aa  345  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  64.75 
 
 
275 aa  340  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  64.48 
 
 
275 aa  339  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  6.88583e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  64.09 
 
 
275 aa  338  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  62.88 
 
 
276 aa  338  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  64.84 
 
 
276 aa  338  5e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  5.61637e-06  decreased coverage  1.03379e-08 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  64.45 
 
 
276 aa  338  6e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  69.47 
 
 
274 aa  338  6e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  65.25 
 
 
275 aa  337  1e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 
275 aa  336  2e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  65.13 
 
 
273 aa  335  3e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  62.5 
 
 
277 aa  336  3e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  62.5 
 
 
277 aa  336  3e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  64.02 
 
 
280 aa  335  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  65.12 
 
 
279 aa  335  6e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  62.5 
 
 
277 aa  332  4e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  63.95 
 
 
276 aa  332  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  64.34 
 
 
274 aa  330  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.33663e-07  hitchhiker  8.56838e-12 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  63.36 
 
 
274 aa  330  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  64.45 
 
 
274 aa  330  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  62.89 
 
 
276 aa  330  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  1.65173e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  63.95 
 
 
274 aa  328  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  61.36 
 
 
275 aa  328  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  63.1 
 
 
279 aa  327  9e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  62.45 
 
 
276 aa  327  1e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.04251e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 
275 aa  327  1e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  60.54 
 
 
276 aa  326  2e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.90971e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  61 
 
 
276 aa  325  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  62.07 
 
 
276 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  62.07 
 
 
276 aa  325  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  62.07 
 
 
276 aa  325  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.01221e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  62.07 
 
 
276 aa  325  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.00839e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  62.07 
 
 
276 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  62.07 
 
 
276 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.00516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  62.07 
 
 
276 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.12601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 
274 aa  325  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  62.45 
 
 
276 aa  324  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.49417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  62.45 
 
 
276 aa  324  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.80933e-09  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  59.92 
 
 
283 aa  324  8e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0301  50S ribosomal protein L2  64.12 
 
 
278 aa  323  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  65.02 
 
 
276 aa  324  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  2.32502e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  62.45 
 
 
276 aa  323  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.87869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  65.02 
 
 
276 aa  324  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.22183e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  60.61 
 
 
277 aa  323  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  64.43 
 
 
276 aa  322  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  60.15 
 
 
276 aa  322  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  62.12 
 
 
277 aa  322  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  62.5 
 
 
277 aa  322  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.99614e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  62.5 
 
 
277 aa  322  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.90927e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 
277 aa  321  7e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  62.26 
 
 
274 aa  321  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.15964e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  62.26 
 
 
274 aa  321  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  62.26 
 
 
274 aa  321  8e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.0829e-09  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  63.08 
 
 
273 aa  320  1e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  61 
 
 
276 aa  320  1e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  62.12 
 
 
277 aa  319  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.95488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  63.22 
 
 
276 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  63.22 
 
 
276 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  63.42 
 
 
274 aa  319  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  62.9 
 
 
274 aa  319  4e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  61 
 
 
276 aa  318  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3706  50S ribosomal protein L2  62.45 
 
 
277 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 
274 aa  315  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.4248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  61.48 
 
 
274 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.06039e-07  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  62.85 
 
 
287 aa  314  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  60.54 
 
 
282 aa  313  1e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  61.02 
 
 
275 aa  313  1e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  61.09 
 
 
274 aa  314  1e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29312e-15 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  60.54 
 
 
282 aa  313  2e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  60.54 
 
 
282 aa  313  2e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  61.13 
 
 
282 aa  313  3e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  62.65 
 
 
274 aa  313  3e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.47453e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  59.77 
 
 
278 aa  312  3e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  3.4721e-28 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0258  ribosomal protein L2  62.07 
 
 
276 aa  313  3e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  61.18 
 
 
273 aa  312  4e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  61.57 
 
 
273 aa  312  4e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.91678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1135  50S ribosomal protein L2  63.88 
 
 
275 aa  312  4e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  9.03374e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
273 aa  311  6e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  3.02361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  60.78 
 
 
273 aa  311  7e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  59.23 
 
 
278 aa  311  9e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.62145e-06  hitchhiker  6.63071e-07 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  60.78 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  60.78 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0605  ribosomal protein L2  61.72 
 
 
274 aa  309  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.397352  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  60.78 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  62.26 
 
 
275 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.31539e-08  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  60.78 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.93877e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  60.78 
 
 
273 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>