More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2213 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  83.19 
 
 		 119 aa  207  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  78.15 
 
 		 119 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  76.47 
 
 		 119 aa  188  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  72.27 
 
 		 119 aa  188  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  70.59 
 
 		 119 aa  177  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  68.07 
 
 		 119 aa  176  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000151304  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  56.14 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 116 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  53.85 
 
 		 128 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  52.25 
 
 		 116 aa  115  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  51.3 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  50.96 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  49.14 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  52.83 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 117 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  49.58 
 
 		 118 aa  113  8.999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  45.69 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  53.54 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  51.49 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  50.96 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  48.33 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  46.28 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  51.4 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2603  50S ribosomal protein L18  58.24 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000566812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  45.38 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  47.5 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  49.12 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  53.27 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  55.45 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  50.96 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  50.94 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  52.69 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  52.53 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  46.72 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  42.37 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  52.53 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  45.38 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  56.84 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  50 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  46.49 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  46.72 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  47.41 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  50.49 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  51.4 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06410  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00978537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  46.22 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  48.15 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  49.55 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  45.9 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  45.9 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  45.9 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  103  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  44.64 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  47.32 
 
 		 123 aa  103  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  47.37 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  56.57 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  50 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  47.01 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  47.01 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  48.08 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  45.38 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  47.11 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  50 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  48.36 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  55.79 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  47.37 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  46.15 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  47.79 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  49.06 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  50.98 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  44.26 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  45.38 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>