More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2208 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  8.57488e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0310  methionine aminopeptidase, type I  81.89 
 
 
265 aa  455  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0001286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2402  methionine aminopeptidase, type I  83.85 
 
 
265 aa  451  1e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00167537  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2043  methionine aminopeptidase, type I  79.09 
 
 
263 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  6.64396e-05  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1830  peptidase M24A  77.52 
 
 
260 aa  427  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  79.07 
 
 
258 aa  424  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0202  peptidase M24A  77.69 
 
 
261 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169894  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  48.24 
 
 
251 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  8.62286e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  52.92 
 
 
248 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  48.83 
 
 
261 aa  254  9e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  49.24 
 
 
262 aa  254  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 
257 aa  253  2e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  47.27 
 
 
265 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  47.67 
 
 
256 aa  248  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.42158e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  46.12 
 
 
255 aa  243  2e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.41129e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  48.05 
 
 
247 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.64848e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  46.48 
 
 
270 aa  242  4e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  45.7 
 
 
249 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  45.7 
 
 
249 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 
249 aa  241  8e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  47.27 
 
 
248 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.8209e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  46.88 
 
 
248 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  46.88 
 
 
248 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.01117e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  46.88 
 
 
248 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.06303e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  47.47 
 
 
254 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.22255e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  46.88 
 
 
248 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.71118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  46.88 
 
 
248 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  3.83298e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  47.49 
 
 
248 aa  239  3e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  47.08 
 
 
248 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  46.48 
 
 
248 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.9178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  45.7 
 
 
272 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  47.66 
 
 
248 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  46.48 
 
 
248 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.3195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  48.25 
 
 
248 aa  235  5e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  45.83 
 
 
255 aa  235  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  45.31 
 
 
248 aa  233  2e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.27766e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  45.14 
 
 
249 aa  233  2e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  46.3 
 
 
273 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  48.18 
 
 
251 aa  233  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.65586e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  45.7 
 
 
255 aa  232  4e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  45.31 
 
 
248 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.84186e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  47.08 
 
 
249 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
262 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  8.63177e-07  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  46.88 
 
 
281 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  44.36 
 
 
266 aa  228  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  45.88 
 
 
253 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  45.88 
 
 
253 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  45.59 
 
 
264 aa  228  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  42.75 
 
 
264 aa  228  9e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  44.14 
 
 
259 aa  227  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  46.31 
 
 
236 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.61795e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  46.31 
 
 
236 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  42.19 
 
 
268 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  46.31 
 
 
236 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.01637e-07  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  44.71 
 
 
259 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  43.92 
 
 
250 aa  225  5e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  46.9 
 
 
259 aa  225  5e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  43.92 
 
 
274 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  44.53 
 
 
256 aa  224  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 
257 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2580  methionine aminopeptidase  44.92 
 
 
290 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  45.91 
 
 
275 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  43.75 
 
 
279 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12113  methionine aminopeptidase, type I  46.72 
 
 
277 aa  221  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0855577  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  43.75 
 
 
279 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  46.27 
 
 
279 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  42.75 
 
 
250 aa  221  1e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  43.14 
 
 
249 aa  221  1e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  44.72 
 
 
259 aa  220  2e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  2.54038e-08 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  43.92 
 
 
250 aa  219  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  9.54293e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  43.14 
 
 
251 aa  218  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  3.38054e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  43.36 
 
 
249 aa  218  6e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  43.32 
 
 
258 aa  218  8e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  43.41 
 
 
254 aa  218  9e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  42.02 
 
 
256 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  44.53 
 
 
285 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  44.75 
 
 
249 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.66875e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  46.27 
 
 
278 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  41.8 
 
 
277 aa  216  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  42.75 
 
 
251 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  8.8934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  44.14 
 
 
281 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  42.19 
 
 
280 aa  216  3e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0681  methionine aminopeptidase, type I  43.14 
 
 
264 aa  216  3e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  44.71 
 
 
269 aa  216  3e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  45.91 
 
 
271 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  45.14 
 
 
250 aa  215  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  1.59906e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  40.86 
 
 
256 aa  216  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  43.75 
 
 
255 aa  215  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  45.14 
 
 
250 aa  215  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  3.64172e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  44.14 
 
 
272 aa  215  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1336  methionine aminopeptidase, type I  41.09 
 
 
256 aa  214  8e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  41.96 
 
 
251 aa  214  1e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  2.26178e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  43.75 
 
 
248 aa  214  1e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  44.53 
 
 
250 aa  214  1e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  4.62112e-06  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  43.36 
 
 
255 aa  214  1e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  42.25 
 
 
250 aa  214  1e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  42.97 
 
 
279 aa  214  1e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  44.75 
 
 
248 aa  213  2e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  44.27 
 
 
276 aa  213  2e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl145  methionine aminopeptidase  43.41 
 
 
252 aa  213  2e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  3.74486e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>