22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2190 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2190  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  702    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  43.32 
 
 		 342 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0329  hypothetical protein  42.62 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0179467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1809  hypothetical protein  36.26 
 
 		 376 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.895599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2021  hypothetical protein  33.24 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0664622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2247  hypothetical protein  40.27 
 
 		 570 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0219  hypothetical protein  38.46 
 
 		 569 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  31.31 
 
 		 555 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3804  hypothetical protein  27.7 
 
 		 538 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.387517  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1499  hypothetical protein  27.94 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0216  hypothetical protein  27.94 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0081  hypothetical protein  29.19 
 
 		 725 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0010  hypothetical protein  28.1 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0509  hypothetical protein  29.73 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0895  hypothetical protein  26.01 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.686581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3301  hypothetical protein  25.59 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01725  hypothetical protein  27.23 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0332705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3504  hypothetical protein  28.19 
 
 		 518 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0663  hypothetical protein  26.79 
 
 		 562 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.43 
 
 		 2195 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.57 
 
 		 2191 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  28 
 
 		 3925 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>