35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2186 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  100 
 
 
882 aa  1795  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.83684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  61.35 
 
 
875 aa  1085  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  71.96 
 
 
881 aa  1319  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  61.29 
 
 
880 aa  1101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  72.84 
 
 
880 aa  1337  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  67.99 
 
 
880 aa  1201  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  66.97 
 
 
881 aa  1170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  39.74 
 
 
947 aa  515  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  33.13 
 
 
993 aa  469  1e-130  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  32.04 
 
 
984 aa  442  1e-122  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  34.37 
 
 
989 aa  441  1e-122  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  34.24 
 
 
991 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  33.07 
 
 
1009 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  31.22 
 
 
1001 aa  407  1e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  28.84 
 
 
1076 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  3.12371e-09 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  31.39 
 
 
1005 aa  381  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  27.91 
 
 
1099 aa  252  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  38.53 
 
 
1109 aa  234  4e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  35.96 
 
 
1093 aa  213  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  34.1 
 
 
1103 aa  200  8e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  31.6 
 
 
619 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  30.29 
 
 
652 aa  99.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  29.79 
 
 
619 aa  95.1  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  32.56 
 
 
621 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  29.15 
 
 
623 aa  87.4  1e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  30.41 
 
 
624 aa  84.3  9e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  28.8 
 
 
1245 aa  83.6  1e-14  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  35.68 
 
 
613 aa  80.9  1e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  32.13 
 
 
619 aa  78.2  7e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  31.16 
 
 
541 aa  75.1  6e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  26.9 
 
 
634 aa  70.5  1e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.01857e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  32.43 
 
 
455 aa  57.8  8e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.2468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0195  hypothetical protein  28.26 
 
 
522 aa  51.6  7e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  27.63 
 
 
580 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  26.34 
 
 
531 aa  44.3  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>