More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2175 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  77.08 
 
 		 401 aa  653    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  84.17 
 
 		 401 aa  704    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  83.42 
 
 		 398 aa  696    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  79.4 
 
 		 397 aa  670    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  100 
 
 		 398 aa  818    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  77.33 
 
 		 401 aa  649    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  82.91 
 
 		 398 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  67.88 
 
 		 394 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  48.96 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.3 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  48.07 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.94 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  46.35 
 
 		 384 aa  352  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  47.5 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  44.59 
 
 		 392 aa  349  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.19 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  46.88 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  46.72 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  47.14 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  47.03 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  49.36 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  47.79 
 
 		 382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  47.53 
 
 		 389 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.02 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  47.53 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  46.61 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  46.51 
 
 		 391 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  45.45 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  47.65 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  47.14 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 391 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  45.97 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.79 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  45.22 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.6 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.48 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  44.87 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  47.66 
 
 		 390 aa  328  7e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  48.23 
 
 		 392 aa  329  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  45.78 
 
 		 393 aa  328  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.71 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  44.02 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.01 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  45.6 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  43.77 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  44.22 
 
 		 402 aa  325  7e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.05 
 
 		 402 aa  325  8.000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  46.02 
 
 		 396 aa  325  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  43.88 
 
 		 397 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  46.04 
 
 		 393 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  46.67 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  46.67 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 		 399 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  43.83 
 
 		 393 aa  322  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.75 
 
 		 398 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  45.31 
 
 		 400 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.56 
 
 		 386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  43.12 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  45.36 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  44.3 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  42.93 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  44.3 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  46.91 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.92 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  44.22 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  43.11 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  45.04 
 
 		 409 aa  309  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  42.86 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  44.7 
 
 		 387 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  43.9 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  45.55 
 
 		 1143 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  44.01 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  44.74 
 
 		 1139 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  40.98 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  41.94 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.29 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  42.34 
 
 		 388 aa  302  6.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  43.99 
 
 		 404 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  43.89 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  42.32 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  41.28 
 
 		 383 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  44.53 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  42.21 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  42.21 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  42.21 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  42.21 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  42.21 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  42.71 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  42.12 
 
 		 383 aa  295  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  43.67 
 
 		 388 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  43.26 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  42.23 
 
 		 380 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  41.62 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  40.15 
 
 		 422 aa  292  6e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 387 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  38.8 
 
 		 388 aa  291  9e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  41.46 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  41.46 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>