More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2163 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  100 
 
 		 453 aa  933    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  49.55 
 
 		 449 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  49.04 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  46.71 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  35.41 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.97 
 
 		 441 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  34.77 
 
 		 479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.85 
 
 		 429 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  33.98 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  33.81 
 
 		 490 aa  190  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  38.35 
 
 		 470 aa  189  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  33.24 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  37.77 
 
 		 440 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  37.77 
 
 		 440 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  37.46 
 
 		 437 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  31.51 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  32.89 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  34.12 
 
 		 490 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.38 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  29.92 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  32.1 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  32.64 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  31.93 
 
 		 517 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  34.04 
 
 		 741 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  31.49 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  32.25 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.29 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  32.08 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.31 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  30.38 
 
 		 474 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.35 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  31.25 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  31.31 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  31.58 
 
 		 475 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  31.58 
 
 		 473 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  30.87 
 
 		 491 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  31.89 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  30.11 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  33.24 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  30.39 
 
 		 447 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  32.87 
 
 		 503 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  30.12 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  39.75 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  29.73 
 
 		 513 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  30.12 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  34.32 
 
 		 438 aa  163  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  30.95 
 
 		 533 aa  163  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.33 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  40.08 
 
 		 386 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  30.64 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  30.36 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  29.86 
 
 		 470 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  39.68 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  40.77 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  31.42 
 
 		 491 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  32.11 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  30.56 
 
 		 569 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  32.96 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  34.26 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  31.84 
 
 		 423 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  32.46 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  31.98 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  29.78 
 
 		 475 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  30.87 
 
 		 475 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  29.47 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  29.47 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  29.47 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  38.36 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  30.58 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  35.06 
 
 		 465 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  31.76 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  32.73 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  31.86 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.61 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  28.97 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  30.71 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  36.82 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  36.65 
 
 		 345 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  31.29 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  31.86 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  30.77 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  28.29 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.31 
 
 		 459 aa  143  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  30.66 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  31.4 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  36.25 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  36.53 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  29.13 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  36.57 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  29.33 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  30.39 
 
 		 466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  29.72 
 
 		 482 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  30.58 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  31.71 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  27.7 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  32.02 
 
 		 665 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  35.39 
 
 		 457 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  34.81 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  35.83 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  30.49 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>