More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2122 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 263 aa  543  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  60.85 
 
 		 264 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  58.24 
 
 		 263 aa  316  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  54 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  50.38 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  54.09 
 
 		 259 aa  258  6e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  44.79 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  40.32 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  36.14 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  37.24 
 
 		 237 aa  148  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.14 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  32.11 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.34 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 		 265 aa  138  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  34.41 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.46 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.29 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  30.95 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.13 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.94 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.71 
 
 		 328 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.56 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.29 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  31.98 
 
 		 233 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.29 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  36.42 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 		 282 aa  95.5  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  35.71 
 
 		 239 aa  95.5  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.7 
 
 		 261 aa  95.5  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  30.38 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  31.35 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.35 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.3 
 
 		 372 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  33.53 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  29.1 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.23 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  28.98 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  37.21 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  34.3 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.96 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.27 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.24 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  31.88 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  33.88 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  25.49 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  31.44 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  34.36 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  28.94 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.91 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  31.44 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  27.31 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  29.74 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.44 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>