More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2117 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  84.84 
 
 
244 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  84.84 
 
 
244 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  81.15 
 
 
244 aa  418  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  80.33 
 
 
244 aa  406  1e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  78.69 
 
 
244 aa  398  1e-110  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  78.69 
 
 
244 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  62.4 
 
 
249 aa  326  2e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  63.79 
 
 
254 aa  318  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  63.6 
 
 
243 aa  315  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  9.37515e-06 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  63.18 
 
 
243 aa  315  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 
246 aa  314  9e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  62.34 
 
 
243 aa  313  1e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  62.76 
 
 
247 aa  312  2e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  61.09 
 
 
245 aa  308  6e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 
251 aa  306  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  61.09 
 
 
246 aa  302  4e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  59.41 
 
 
240 aa  301  8e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  59 
 
 
310 aa  301  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  60.25 
 
 
244 aa  300  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  60.08 
 
 
239 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  60.17 
 
 
247 aa  298  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.75 
 
 
241 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 
246 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  57.74 
 
 
240 aa  295  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.33 
 
 
241 aa  295  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  60.08 
 
 
246 aa  295  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.82009e-07 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  56.43 
 
 
241 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  57.26 
 
 
241 aa  295  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  59.58 
 
 
242 aa  294  8e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.5 
 
 
268 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  58.23 
 
 
333 aa  293  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  57.79 
 
 
249 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 
261 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  59 
 
 
243 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
258 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  57.79 
 
 
249 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  57.08 
 
 
321 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.9 
 
 
240 aa  292  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
241 aa  292  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 
258 aa  292  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 
262 aa  292  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  59.66 
 
 
277 aa  292  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  59.59 
 
 
261 aa  292  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.23 
 
 
336 aa  291  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  59.59 
 
 
258 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  58.75 
 
 
258 aa  291  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  57.81 
 
 
247 aa  291  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  59.59 
 
 
258 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  56.67 
 
 
256 aa  291  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  59.59 
 
 
258 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
258 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
258 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
258 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
258 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
258 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 
258 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  59.59 
 
 
258 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.43 
 
 
255 aa  291  8e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 
332 aa  291  8e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  59.83 
 
 
244 aa  291  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  56.43 
 
 
279 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  60.76 
 
 
283 aa  290  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  58.51 
 
 
241 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  54.85 
 
 
258 aa  290  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 
241 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  59.59 
 
 
258 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  59.59 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  57.5 
 
 
261 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  58.61 
 
 
262 aa  289  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
254 aa  289  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  59.59 
 
 
258 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  57.38 
 
 
317 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  58.33 
 
 
258 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
277 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  59.18 
 
 
260 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  58.61 
 
 
262 aa  289  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  58.58 
 
 
241 aa  289  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  59.66 
 
 
246 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.4361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  58.75 
 
 
241 aa  289  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  56.9 
 
 
316 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  55.92 
 
 
262 aa  288  5e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  55.82 
 
 
264 aa  288  5e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  57.81 
 
 
314 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  53.11 
 
 
256 aa  288  6e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  55.65 
 
 
240 aa  288  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  56.12 
 
 
264 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  55.23 
 
 
253 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  55.23 
 
 
253 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  54.17 
 
 
253 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
243 aa  286  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  56.67 
 
 
311 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  58.33 
 
 
268 aa  286  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  56.1 
 
 
264 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.5 
 
 
241 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  59.41 
 
 
243 aa  286  3e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  59.83 
 
 
243 aa  286  3e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  59.83 
 
 
243 aa  286  3e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  59.83 
 
 
243 aa  286  3e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  59.83 
 
 
243 aa  286  3e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>