More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2116 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2116  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2541  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  88.82 
 
 
171 aa  322  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2271  acetyltransferase  87.86 
 
 
173 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  83.52 
 
 
177 aa  314  7e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0290  acetyltransferase  84.21 
 
 
180 aa  310  9e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0175113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  75.58 
 
 
180 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1936  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  70.29 
 
 
177 aa  268  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  48.82 
 
 
174 aa  177  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  49.38 
 
 
169 aa  175  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  48.26 
 
 
182 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  50.3 
 
 
175 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  50.3 
 
 
175 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  49.7 
 
 
175 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  42.86 
 
 
170 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  42.94 
 
 
172 aa  160  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04630  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  45.93 
 
 
173 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.506175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  47.37 
 
 
185 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.31 
 
 
185 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.68 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0466  hexapeptide transferase family protein  43.86 
 
 
171 aa  152  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  45.12 
 
 
172 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  42.69 
 
 
175 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  44.57 
 
 
189 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  48.47 
 
 
189 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  41.92 
 
 
173 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  43.6 
 
 
182 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  43.37 
 
 
170 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  44.07 
 
 
185 aa  148  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  42.29 
 
 
184 aa  148  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  44.58 
 
 
170 aa  148  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  43.98 
 
 
172 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  41.48 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  41.48 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  41.48 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4655  transferase family protein  43.37 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4511  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  43.37 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  41.48 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  41.48 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  46.24 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5010  transferase family protein  43.37 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4879  transferase family protein  43.37 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4587  acetyltransferase/acyltransferase  43.37 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  41.48 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  43.93 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  41.48 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0108  ferripyochelin binding protein (fbp)  41.98 
 
 
168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4870  transferase family protein  42.77 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  41.48 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  43.35 
 
 
177 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3658  acetyltransferase/carbonic anhydrase  40 
 
 
175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  46.78 
 
 
179 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  41.48 
 
 
256 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4905  transferase family protein  42.17 
 
 
170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  41.34 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  41.34 
 
 
182 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  45.83 
 
 
192 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  44.85 
 
 
189 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  43.35 
 
 
182 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  44.17 
 
 
185 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4493  transferase; acetyltransferase/acyltransferase  42.17 
 
 
170 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4896  transferase family protein  42.17 
 
 
170 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  44.44 
 
 
186 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4073  acetyltransferase/carbonic anhydrase  40.59 
 
 
175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.213476  hitchhiker  0.00780432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  42.77 
 
 
182 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  43.02 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  42.42 
 
 
167 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  40.34 
 
 
184 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  42.77 
 
 
182 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0011  acetyltransferase/carbonic anhydrase  39.05 
 
 
169 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  41.34 
 
 
179 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  41.71 
 
 
180 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  43.45 
 
 
182 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  41.48 
 
 
182 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  43.35 
 
 
182 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  43.35 
 
 
182 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0370  transferase family protein  42.17 
 
 
170 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  42.86 
 
 
180 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0197  transferase hexapeptide protein  43.71 
 
 
173 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.876343  normal  0.740105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  43.35 
 
 
182 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  45.93 
 
 
176 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  40.91 
 
 
182 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  42.6 
 
 
183 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  43.9 
 
 
178 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.52 
 
 
182 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  44.91 
 
 
178 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  44.17 
 
 
180 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  43.35 
 
 
182 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  43.75 
 
 
177 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  41.18 
 
 
176 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  42.59 
 
 
168 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  47.34 
 
 
175 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 
179 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  44.97 
 
 
178 aa  141  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  45.83 
 
 
180 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  41.21 
 
 
167 aa  141  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  44.05 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  42.2 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06060  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  41.82 
 
 
171 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0246  carbonic anhydrase  43.29 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  41.52 
 
 
177 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>