More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2085 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2085  Aldehyde Dehydrogenase_  100 
 
 
454 aa  923    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2158  aldehyde dehydrogenase  63.05 
 
 
462 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.734921  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2489  Aldehyde Dehydrogenase  61.47 
 
 
463 aa  568  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0300  aldehyde dehydrogenase  54.12 
 
 
458 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0223565  hitchhiker  0.0000134902 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1754  aldehyde dehydrogenase  56.5 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  49.56 
 
 
469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.604526  decreased coverage  0.00230582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1918  Aldehyde Dehydrogenase  51.22 
 
 
475 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3615  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
460 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.30982  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  46.36 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2652  aldehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
459 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2358  aldehyde Dehydrogenase  45.11 
 
 
461 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2181  Aldehyde Dehydrogenase  47.4 
 
 
456 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  47.45 
 
 
465 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00587  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0489  aldehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0498787 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21711  putative aldehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
459 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0450332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0449  Aldehyde Dehydrogenase  44.59 
 
 
456 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2512  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  42.16 
 
 
457 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00297812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  47.87 
 
 
481 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0170872  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2010  aldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
459 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1977  aldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
459 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.205682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1176  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  45.18 
 
 
455 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0497  putative aldehyde dehydrogenase  47.17 
 
 
459 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04241  putative aldehyde dehydrogenase  42.51 
 
 
459 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.844488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1198  aldehyde dehydrogenase  44.95 
 
 
455 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1178  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.95 
 
 
455 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.198851  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1709  putative aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
459 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0791372  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1838  putative aldehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
459 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1296  aldehyde dehydrogenase  44.95 
 
 
455 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03681  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.04 
 
 
449 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.975414  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1374  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.95 
 
 
455 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1456  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
459 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.133276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1397  aldehyde dehydrogenase  44.5 
 
 
455 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4008  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.24 
 
 
455 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.148119  hitchhiker  0.00000000000192548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1438  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.5 
 
 
455 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1930  Aldehyde Dehydrogenase  50.7 
 
 
480 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1200  aldehyde dehydrogenase  45.18 
 
 
455 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2296  aldehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
458 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.69034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1336  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.78 
 
 
455 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1965  Aldehyde Dehydrogenase  44.15 
 
 
468 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4713  aldehyde dehydrogenase  41.28 
 
 
442 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2610  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
458 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.514086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3041  aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
461 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08936  aldehyde dehydrogenase  39.82 
 
 
457 aa  362  6e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.539716  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0080  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
470 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0742  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
468 aa  362  9e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1006  aldehyde dehydrogenase  45.94 
 
 
454 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44 
 
 
481 aa  359  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0099  aldehyde dehydrogenase  42.7 
 
 
470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0090  aldehyde dehydrogenase  42.7 
 
 
470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0078  aldehyde dehydrogenase  46.05 
 
 
474 aa  356  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0105  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
470 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01050  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 
504 aa  353  4e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.958772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2364  aldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 
475 aa  351  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0648683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0238  aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
474 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851453  decreased coverage  0.000681524 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2479  Aldehyde Dehydrogenase  39.6 
 
 
469 aa  347  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.410895  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  42.62 
 
 
462 aa  344  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0821  Aldehyde Dehydrogenase  43.54 
 
 
475 aa  336  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0672695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0607  aldehyde dehydrogenase  41.31 
 
 
484 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1742  Aldehyde Dehydrogenase  39.43 
 
 
476 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2238  aldehyde dehydrogenase  39.49 
 
 
472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0337  putative aldehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.704736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0438  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
484 aa  319  7.999999999999999e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0433999  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03571  putative aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
463 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1830  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
441 aa  317  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03581  putative aldehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
463 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.995721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1254  aldehyde dehydrogenase  43.43 
 
 
471 aa  315  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38059  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03631  putative aldehyde dehydrogenase  36.7 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  40.7 
 
 
473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0440  aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461443  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  42.25 
 
 
477 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
474 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
480 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
465 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0503  Aldehyde Dehydrogenase  38.67 
 
 
456 aa  310  4e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.958957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
474 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  37.66 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  41.12 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  36.88 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  37.78 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
472 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
472 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
472 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
472 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
486 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
472 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
476 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
472 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
475 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  39.65 
 
 
472 aa  305  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 
474 aa  306  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 
473 aa  306  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
474 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  41.53 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>