More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2081 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
381 aa  785    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  76.38 
 
 
390 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  68.25 
 
 
387 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  68.82 
 
 
372 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  66.58 
 
 
376 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  62.63 
 
 
379 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  60.43 
 
 
378 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
383 aa  236  7e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.32 
 
 
380 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.69 
 
 
380 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
380 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  33.33 
 
 
382 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.91 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.91 
 
 
380 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  30.91 
 
 
380 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.43 
 
 
380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.17 
 
 
380 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  32.47 
 
 
382 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  32.47 
 
 
382 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.73 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  31.44 
 
 
382 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
401 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  31.65 
 
 
381 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
378 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
377 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
377 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
381 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  32.46 
 
 
393 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
385 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
377 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  30.99 
 
 
385 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
377 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  31.05 
 
 
377 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  31.78 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  30.79 
 
 
377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
387 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
385 aa  196  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.95 
 
 
377 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
427 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3802  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
394 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.769025  normal  0.0224743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  29.63 
 
 
381 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  30.47 
 
 
373 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
396 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
403 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.11 
 
 
396 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
403 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
432 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  32.51 
 
 
406 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  32.98 
 
 
679 aa  186  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 
403 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  31.42 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
384 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  29.49 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
655 aa  182  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  28.24 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
375 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
400 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
416 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
434 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
405 aa  176  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
404 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
406 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
374 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
387 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
375 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
385 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
819 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3237  putative glycosyltransferase  31.33 
 
 
343 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
420 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  31.71 
 
 
803 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
426 aa  166  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2309  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
344 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1912  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
350 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1322  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
803 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2187  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0604226  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
812 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
441 aa  164  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5598  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2235  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
350 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.260131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>