91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2079 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 
417 aa  841  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  73.07 
 
 
400 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  60.25 
 
 
408 aa  481  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  62.22 
 
 
401 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  31.78 
 
 
383 aa  184  2e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  30.33 
 
 
381 aa  164  2e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  30.77 
 
 
387 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  29.44 
 
 
379 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  27.75 
 
 
377 aa  148  2e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  29.76 
 
 
1101 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  31.62 
 
 
395 aa  142  1e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  30.42 
 
 
365 aa  137  3e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  30.85 
 
 
389 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  29.95 
 
 
373 aa  134  2e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.57 
 
 
379 aa  135  2e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  31.86 
 
 
379 aa  132  8e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  26.43 
 
 
402 aa  132  1e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  25.68 
 
 
396 aa  130  4e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  25.19 
 
 
396 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33222e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.02 
 
 
376 aa  126  8e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  8.47515e-09 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  29.74 
 
 
387 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  28.49 
 
 
395 aa  123  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  29.74 
 
 
387 aa  121  2e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  24.94 
 
 
396 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  24.5 
 
 
396 aa  114  4e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  27.92 
 
 
416 aa  113  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  30.03 
 
 
1852 aa  110  4e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  22.91 
 
 
427 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  25.86 
 
 
375 aa  90.1  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  26.84 
 
 
501 aa  81.3  3e-14  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  24.82 
 
 
406 aa  73.2  7e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.08 
 
 
932 aa  72.4  1e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  25.67 
 
 
371 aa  68.9  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.41 
 
 
400 aa  67  5e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  25 
 
 
382 aa  66.6  7e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  23.96 
 
 
467 aa  65.5  2e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  24.74 
 
 
468 aa  65.5  2e-09  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  22.37 
 
 
382 aa  65.5  2e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  23.89 
 
 
381 aa  63.9  5e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  21.91 
 
 
933 aa  63.9  5e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  23.63 
 
 
386 aa  63.2  8e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  23.96 
 
 
467 aa  62.8  1e-08  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  27.04 
 
 
389 aa  62.4  1e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  23.41 
 
 
350 aa  62.4  1e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  4.43325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  27.25 
 
 
460 aa  62.4  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  24.69 
 
 
447 aa  62.8  1e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  27.2 
 
 
398 aa  62  2e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  25.21 
 
 
392 aa  61.6  2e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  27.2 
 
 
398 aa  61.6  3e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  29.82 
 
 
390 aa  60.8  5e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  29.82 
 
 
390 aa  60.8  5e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  27.27 
 
 
368 aa  59.7  1e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  26.29 
 
 
383 aa  59.7  1e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.35133e-15  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  22.39 
 
 
377 aa  58.5  2e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  27.87 
 
 
386 aa  58.9  2e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.53 
 
 
931 aa  57.8  3e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  26.41 
 
 
404 aa  57.8  4e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  25.28 
 
 
400 aa  57.8  4e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  20.9 
 
 
934 aa  57  6e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  24.24 
 
 
378 aa  55.8  1e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  23.57 
 
 
379 aa  55.5  2e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  24.61 
 
 
385 aa  54.7  3e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  23.72 
 
 
386 aa  54.3  4e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  25.3 
 
 
386 aa  54.3  4e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  23.64 
 
 
386 aa  54.3  4e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  26.94 
 
 
464 aa  53.9  5e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  25.78 
 
 
402 aa  53.9  6e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  22.12 
 
 
382 aa  52  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  23.97 
 
 
385 aa  51.6  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  21.05 
 
 
629 aa  50.4  6e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  23.26 
 
 
383 aa  50.1  8e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  25.26 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  22.93 
 
 
384 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  22.93 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  22.93 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  22.93 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  22.93 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  22.93 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  22.93 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  23.74 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  25.48 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  22.66 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  24.78 
 
 
374 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  25.23 
 
 
374 aa  46.6  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  22.11 
 
 
806 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  23.75 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  23.43 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  28.14 
 
 
375 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  22.16 
 
 
387 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  22.16 
 
 
387 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  24.38 
 
 
385 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>