31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2073 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  434  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  6.12499e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  71.1 
 
 
218 aa  328  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  56.34 
 
 
225 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  54.42 
 
 
226 aa  248  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  46.54 
 
 
266 aa  217  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  36.21 
 
 
228 aa  147  1e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1503  protein of unknown function DUF975  34.1 
 
 
259 aa  130  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  34.9 
 
 
245 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  29.17 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2424  hypothetical protein  36.16 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.129436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  32.09 
 
 
245 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  27.75 
 
 
195 aa  67  2e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  7.10568e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  29.45 
 
 
335 aa  62.4  4e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  26.76 
 
 
335 aa  61.2  1e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  32.28 
 
 
327 aa  60.5  2e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  29.79 
 
 
229 aa  57  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  29.79 
 
 
317 aa  57  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  29.79 
 
 
317 aa  57  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  23.28 
 
 
281 aa  52.8  4e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.82734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0384  hypothetical protein  22.81 
 
 
236 aa  52  6e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  26.45 
 
 
248 aa  51.6  9e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  24.31 
 
 
265 aa  50.4  2e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.14785e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  25.34 
 
 
265 aa  49.7  3e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  25.32 
 
 
247 aa  49.3  4e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  29.66 
 
 
323 aa  48.5  9e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  25 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  31.01 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09278  hypothetical protein  26.74 
 
 
296 aa  42.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.237107  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  25.33 
 
 
262 aa  41.6  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1749  hypothetical protein  25.33 
 
 
253 aa  41.6  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000252365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>