More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2058 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  100 
 
 
460 aa  919    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  86.3 
 
 
460 aa  785    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  81.96 
 
 
460 aa  764    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  83.7 
 
 
460 aa  750    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  85 
 
 
460 aa  771    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  88.91 
 
 
460 aa  805    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  81.52 
 
 
460 aa  768    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  56.93 
 
 
463 aa  525  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  54.65 
 
 
460 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2002  magnesium transporter  53.41 
 
 
458 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.493999  normal  0.0929187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  50.55 
 
 
458 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  43.39 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  45.18 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  45.27 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  43.79 
 
 
454 aa  356  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  42.89 
 
 
461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  40.79 
 
 
449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  43.75 
 
 
454 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  43.24 
 
 
465 aa  352  8e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  43.24 
 
 
465 aa  352  8e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  44.19 
 
 
456 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  44.21 
 
 
455 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  46.85 
 
 
441 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  46.62 
 
 
441 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  46.62 
 
 
441 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  42.36 
 
 
456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  41.83 
 
 
458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  46.79 
 
 
456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  38.99 
 
 
449 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  37.61 
 
 
454 aa  332  8e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  39.02 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  43.07 
 
 
457 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  40.18 
 
 
468 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  46.47 
 
 
438 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  43.2 
 
 
457 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  39.52 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  38.62 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  38.53 
 
 
466 aa  312  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  36 
 
 
455 aa  311  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  40.09 
 
 
458 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  37.88 
 
 
463 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  37.36 
 
 
446 aa  299  8e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  36.36 
 
 
449 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  36.38 
 
 
447 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  34.81 
 
 
452 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  37.36 
 
 
446 aa  288  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  36.88 
 
 
452 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  37.36 
 
 
462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  37.36 
 
 
462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  32.66 
 
 
444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  36.62 
 
 
469 aa  286  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  36.4 
 
 
469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  33.92 
 
 
454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  37.36 
 
 
454 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  37.83 
 
 
450 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  32.28 
 
 
443 aa  277  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  35.76 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  37.36 
 
 
486 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  35.35 
 
 
447 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  35.71 
 
 
468 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  34.88 
 
 
468 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  32.66 
 
 
456 aa  270  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  35.49 
 
 
486 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  34.73 
 
 
468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  32.97 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  35.27 
 
 
450 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  32.21 
 
 
449 aa  263  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  34.68 
 
 
452 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  32.45 
 
 
452 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  37.95 
 
 
473 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  32.6 
 
 
457 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  34.28 
 
 
447 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  28.95 
 
 
454 aa  257  3e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  36.61 
 
 
447 aa  256  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  32.53 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  34.11 
 
 
465 aa  253  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  31.83 
 
 
458 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  32.02 
 
 
445 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  37.47 
 
 
471 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  32.59 
 
 
451 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  32.14 
 
 
442 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  33.63 
 
 
463 aa  249  7e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  34.73 
 
 
462 aa  249  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  32.74 
 
 
445 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  33.11 
 
 
450 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  32.82 
 
 
457 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  32.09 
 
 
445 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  32.38 
 
 
457 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  32.82 
 
 
457 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  34.37 
 
 
449 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  34.68 
 
 
445 aa  246  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  34.87 
 
 
454 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  32.38 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  32.13 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  32.43 
 
 
454 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  33.55 
 
 
461 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  33.41 
 
 
444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4176  magnesium transporter  36.17 
 
 
452 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.987951  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  34.14 
 
 
461 aa  236  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  34.14 
 
 
461 aa  236  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>