More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2037 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
465 aa  962    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  67.92 
 
 
402 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  63.68 
 
 
402 aa  522  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.04 
 
 
403 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0340  exodeoxyribonuclease VII large subunit  60.8 
 
 
402 aa  474  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  58.52 
 
 
411 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0321  exodeoxyribonuclease VII large subunit  59.39 
 
 
407 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.568977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.14 
 
 
453 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4728  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.27 
 
 
392 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.36 
 
 
401 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.79 
 
 
404 aa  279  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.82 
 
 
458 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.04 
 
 
458 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1356  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.27 
 
 
406 aa  276  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.72 
 
 
400 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.47 
 
 
400 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.95 
 
 
405 aa  275  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000332629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.18 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.86 
 
 
398 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.88 
 
 
410 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.96 
 
 
407 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.6 
 
 
423 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.33 
 
 
448 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.78 
 
 
452 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.04 
 
 
526 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.78 
 
 
452 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.1 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.1 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.1 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.1 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.1 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.1 
 
 
452 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.1 
 
 
452 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1695  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.27 
 
 
536 aa  266  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.54 
 
 
398 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.03 
 
 
414 aa  264  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.77 
 
 
414 aa  264  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.73 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.15 
 
 
416 aa  263  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.91 
 
 
396 aa  262  8.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1238  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  48.82 
 
 
549 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.122237  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.31 
 
 
406 aa  262  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.11 
 
 
407 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.74 
 
 
511 aa  260  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.74 
 
 
511 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0430  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.59 
 
 
414 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.19 
 
 
476 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.77 
 
 
448 aa  259  7e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1719  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.8 
 
 
454 aa  259  8e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.623668  hitchhiker  0.0000296907 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.94 
 
 
411 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1536  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.88 
 
 
401 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0037923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.8 
 
 
454 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.49 
 
 
451 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.96 
 
 
453 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.33 
 
 
475 aa  257  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.14 
 
 
463 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.36 
 
 
407 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2996  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.39 
 
 
527 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.12 
 
 
541 aa  256  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.66 
 
 
403 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.6 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.63 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4284  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.28 
 
 
527 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671183  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0620  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.41 
 
 
477 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419722  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3174  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.69 
 
 
541 aa  254  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.515348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.07 
 
 
451 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4549  exodeoxyribonuclease VII large subunit  51.15 
 
 
526 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.81 
 
 
445 aa  253  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.74 
 
 
463 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6605  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.15 
 
 
531 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0079449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.77 
 
 
463 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.12 
 
 
457 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1859  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.25 
 
 
538 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.020819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.32 
 
 
446 aa  249  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1352  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.07 
 
 
537 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60305  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.57 
 
 
459 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.7 
 
 
446 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  41.64 
 
 
452 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.45 
 
 
536 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.27 
 
 
447 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.46 
 
 
388 aa  247  3e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.64 
 
 
463 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.16 
 
 
402 aa  247  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3148  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.45 
 
 
492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.54 
 
 
445 aa  246  6.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0628  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.67 
 
 
485 aa  246  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.13 
 
 
393 aa  246  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.37 
 
 
407 aa  245  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000325061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.48 
 
 
519 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4621  exodeoxyribonuclease VII large subunit  47.02 
 
 
541 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.78 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.17 
 
 
422 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.08 
 
 
469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  41.4 
 
 
447 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  37.94 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0667  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  45.95 
 
 
566 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.36 
 
 
449 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.76 
 
 
465 aa  244  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.99 
 
 
444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>