More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2007 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  66.81 
 
 
240 aa  337  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  65.13 
 
 
239 aa  332  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.61 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  44.77 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 
249 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
250 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
243 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
270 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
242 aa  201  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 
255 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.95 
 
 
252 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.08 
 
 
276 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
264 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  43.35 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  43.78 
 
 
246 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  41.18 
 
 
255 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
259 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  41.18 
 
 
255 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 
253 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
246 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
270 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
244 aa  191  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  39.5 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
250 aa  187  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.14 
 
 
261 aa  187  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 
271 aa  185  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
256 aa  185  7e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.67 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.82 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.22 
 
 
280 aa  182  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
256 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.35 
 
 
252 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 
276 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  38.66 
 
 
291 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
456 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.27 
 
 
286 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.75 
 
 
277 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
288 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
541 aa  175  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
278 aa  175  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 
273 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
453 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  38.4 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  38.62 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  40.09 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  40.09 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  40.09 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.34 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.34 
 
 
278 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.91 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.24 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.13 
 
 
440 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 
280 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 
277 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 
281 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.17 
 
 
280 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.66 
 
 
310 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
280 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
300 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
300 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
280 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
280 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
280 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.67 
 
 
280 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
300 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 
285 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 
267 aa  169  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.83 
 
 
284 aa  168  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.16 
 
 
277 aa  168  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 
281 aa  167  9e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.83 
 
 
285 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.83 
 
 
283 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 
281 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  41.98 
 
 
232 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.28 
 
 
305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
255 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.18 
 
 
280 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.73 
 
 
277 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.51 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 
288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  36.45 
 
 
242 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.2 
 
 
344 aa  163  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 
395 aa  163  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  38.27 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  38.27 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.12 
 
 
272 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  35.12 
 
 
380 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 
271 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  36.07 
 
 
288 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0226  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.59 
 
 
285 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  36.78 
 
 
284 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>