More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2002 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  82.66 
 
 
483 aa  829    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  84.96 
 
 
480 aa  862    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  82.63 
 
 
482 aa  819    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  100 
 
 
480 aa  986    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  84.32 
 
 
477 aa  852    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  81.36 
 
 
482 aa  816    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  61.79 
 
 
468 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  61.46 
 
 
469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.61 
 
 
466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.94 
 
 
469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  61.09 
 
 
466 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  61.66 
 
 
464 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  61.34 
 
 
463 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  61.3 
 
 
469 aa  545  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.61 
 
 
464 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  57.93 
 
 
470 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.26 
 
 
479 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  61.35 
 
 
463 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.9 
 
 
461 aa  525  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  57.82 
 
 
462 aa  525  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  55.77 
 
 
465 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.12 
 
 
761 aa  524  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.01 
 
 
480 aa  521  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.74 
 
 
465 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  55.34 
 
 
465 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  56.69 
 
 
469 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.14 
 
 
466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.62 
 
 
497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  55.06 
 
 
503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  56.51 
 
 
476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  58.17 
 
 
455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  55.49 
 
 
470 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  55.72 
 
 
471 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  54.77 
 
 
476 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  56.2 
 
 
476 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  55.24 
 
 
468 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  55.46 
 
 
468 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55 
 
 
457 aa  503  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  55.93 
 
 
481 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.18 
 
 
467 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  55.75 
 
 
468 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  55.75 
 
 
468 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  57.27 
 
 
459 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.99 
 
 
469 aa  488  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.84 
 
 
474 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  55.93 
 
 
476 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  52.75 
 
 
469 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.6 
 
 
463 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  52.33 
 
 
469 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.05 
 
 
464 aa  481  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  53.57 
 
 
473 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.49 
 
 
465 aa  479  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.22 
 
 
447 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  56.1 
 
 
446 aa  475  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  52.93 
 
 
473 aa  472  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.15 
 
 
467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.15 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.22 
 
 
458 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.33 
 
 
447 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  52.12 
 
 
1011 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  52.12 
 
 
1011 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  52.7 
 
 
994 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.33 
 
 
448 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  53.5 
 
 
747 aa  461  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.69 
 
 
1008 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.91 
 
 
1005 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  50.97 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  53.03 
 
 
994 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.94 
 
 
942 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  44.76 
 
 
944 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  44.17 
 
 
944 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  45.09 
 
 
465 aa  356  5e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  44.07 
 
 
947 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5203  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.97 
 
 
944 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  40.9 
 
 
469 aa  346  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.49 
 
 
483 aa  341  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  43.2 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.58 
 
 
438 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.51 
 
 
658 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  38.38 
 
 
470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  39.78 
 
 
468 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 
440 aa  323  4e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  39.57 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  39.91 
 
 
473 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  39.69 
 
 
477 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  39.29 
 
 
659 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  39.29 
 
 
659 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.29 
 
 
659 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.07 
 
 
659 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.29 
 
 
659 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.29 
 
 
659 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  39.29 
 
 
659 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  39.25 
 
 
477 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  40.13 
 
 
472 aa  317  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.21 
 
 
653 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.29 
 
 
659 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.21 
 
 
653 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.21 
 
 
653 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.81 
 
 
674 aa  316  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  38.84 
 
 
469 aa  316  7e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>