26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1994 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 269 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  66.82 
 
 		 218 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  66.07 
 
 		 226 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  66.67 
 
 		 211 aa  274  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  60.99 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  62.12 
 
 		 206 aa  245  6.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  55.5 
 
 		 220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  28.79 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  28.43 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03177  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13270)  29.38 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0441776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  31.47 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  25.58 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  29.85 
 
 		 444 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  26.7 
 
 		 410 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  32.31 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  29.14 
 
 		 387 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0524  phosphatidate cytidylyltransferase  31.86 
 
 		 183 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  27.83 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1439  hypothetical protein  36.59 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  35.09 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1815  phosphatidate cytidylyltransferase  29.69 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  29.63 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>