More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1969 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000507932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.19 
 
 
274 aa  428  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000578748  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  75.28 
 
 
274 aa  425  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.46 
 
 
274 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  71.69 
 
 
274 aa  394  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.03 
 
 
275 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.37 
 
 
274 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
279 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
266 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
256 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
258 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  34.96 
 
 
254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  32.79 
 
 
261 aa  118  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  32.67 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.15 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.68 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.86 
 
 
252 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
262 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  33.84 
 
 
251 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  33.06 
 
 
261 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.16 
 
 
264 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.16 
 
 
264 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.16 
 
 
264 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
261 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  31.87 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  31.87 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  31.87 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 
255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  32 
 
 
261 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.18 
 
 
258 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  31.87 
 
 
261 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 
246 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6613  NYC1; chlorophyll b reductase  35.75 
 
 
254 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0625441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
276 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  35.05 
 
 
252 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  35.62 
 
 
258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  31.87 
 
 
261 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
282 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
282 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  32 
 
 
261 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
257 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
250 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  31.87 
 
 
261 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
282 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
246 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  31.47 
 
 
261 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
266 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
257 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
248 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
262 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
269 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.43 
 
 
247 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
255 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
257 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
264 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
244 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
246 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
246 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
255 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
262 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.61 
 
 
246 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.98 
 
 
249 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
252 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.34 
 
 
246 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
266 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
255 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
248 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
246 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.34353  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
262 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
277 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
242 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
239 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
242 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
242 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 
255 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.49 
 
 
246 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
242 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
239 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.22 
 
 
261 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
239 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.68 
 
 
260 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
255 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.63 
 
 
247 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
239 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 
254 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>