More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1915 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  100 
 
 		 613 aa  1244    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  46.39 
 
 		 614 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  43.07 
 
 		 592 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.48 
 
 		 600 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  41.06 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  39.6 
 
 		 618 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  44.86 
 
 		 625 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 609 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  37.37 
 
 		 611 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  44.24 
 
 		 625 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  37.24 
 
 		 621 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  37.21 
 
 		 604 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  37.24 
 
 		 621 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  37.41 
 
 		 621 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  38.68 
 
 		 605 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  38.18 
 
 		 611 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  36.43 
 
 		 616 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 626 aa  379  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  36.45 
 
 		 619 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  34.92 
 
 		 605 aa  363  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  37.59 
 
 		 606 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  35.55 
 
 		 615 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  35.62 
 
 		 613 aa  349  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  35.11 
 
 		 603 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  33.73 
 
 		 618 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  34.87 
 
 		 625 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 		 618 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.75 
 
 		 603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  34.57 
 
 		 626 aa  336  7.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  33.56 
 
 		 618 aa  336  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  35.99 
 
 		 615 aa  330  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  35.2 
 
 		 623 aa  330  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  35.44 
 
 		 638 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  33.89 
 
 		 597 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  34.63 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  31.48 
 
 		 608 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  33.39 
 
 		 608 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  32.27 
 
 		 626 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  31.9 
 
 		 616 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  35.73 
 
 		 599 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  32.84 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.39 
 
 		 619 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.92 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.06 
 
 		 603 aa  257  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 		 603 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.64 
 
 		 587 aa  253  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  31.52 
 
 		 566 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  32.92 
 
 		 662 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  33.11 
 
 		 616 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  31.91 
 
 		 595 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  27.92 
 
 		 618 aa  248  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  31.52 
 
 		 633 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  28.86 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.93 
 
 		 575 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  29.84 
 
 		 604 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  33.03 
 
 		 606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  33.48 
 
 		 619 aa  234  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  33.4 
 
 		 653 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.66 
 
 		 594 aa  232  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  30.19 
 
 		 619 aa  232  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  32.84 
 
 		 627 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  32.37 
 
 		 591 aa  231  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  31.97 
 
 		 601 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  27.94 
 
 		 611 aa  226  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  27.73 
 
 		 610 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  30.57 
 
 		 593 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  29.04 
 
 		 611 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.14 
 
 		 580 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  33.41 
 
 		 618 aa  223  7e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.21 
 
 		 584 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  32.82 
 
 		 673 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  28.92 
 
 		 596 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.25 
 
 		 597 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.25 
 
 		 597 aa  221  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.81 
 
 		 597 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  34.51 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.88 
 
 		 600 aa  220  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.54 
 
 		 608 aa  220  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.36 
 
 		 600 aa  220  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  35.86 
 
 		 665 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.08 
 
 		 586 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  28.7 
 
 		 617 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  31.4 
 
 		 721 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  34.2 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.14 
 
 		 600 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  36.34 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.4 
 
 		 618 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  35.64 
 
 		 572 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  34.51 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.91 
 
 		 614 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 623 aa  219  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.14 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.46 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 596 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.88 
 
 		 586 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.42 
 
 		 619 aa  217  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.03 
 
 		 600 aa  218  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.6 
 
 		 566 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  33.47 
 
 		 611 aa  217  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>