More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1871 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.06 
 
 
3954 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
1855 aa  3357    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  40.72 
 
 
4334 aa  801    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 
2467 aa  400  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  41.28 
 
 
824 aa  393  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  33.8 
 
 
1884 aa  355  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  42.35 
 
 
2807 aa  348  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  34.45 
 
 
1400 aa  348  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.66 
 
 
1415 aa  330  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  31.6 
 
 
4800 aa  327  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  48.78 
 
 
2133 aa  303  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.62 
 
 
1363 aa  292  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  47.51 
 
 
2198 aa  264  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.96 
 
 
1145 aa  251  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  53.72 
 
 
3209 aa  248  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  37.21 
 
 
946 aa  243  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.71 
 
 
1279 aa  243  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.63 
 
 
1079 aa  242  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  49.36 
 
 
3619 aa  239  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  46.51 
 
 
3608 aa  238  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  34.49 
 
 
1133 aa  234  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  49.11 
 
 
3619 aa  234  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  36.92 
 
 
1764 aa  233  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  36.75 
 
 
1134 aa  231  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  29.17 
 
 
3026 aa  225  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  30.66 
 
 
2954 aa  219  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  36.04 
 
 
1197 aa  217  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.8 
 
 
2911 aa  216  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.58 
 
 
1532 aa  215  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  36.33 
 
 
1534 aa  211  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  33.52 
 
 
965 aa  209  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.13 
 
 
1499 aa  199  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.63 
 
 
1156 aa  194  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  28.93 
 
 
2097 aa  189  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.23 
 
 
1544 aa  184  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.52 
 
 
1795 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  33.33 
 
 
860 aa  180  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.06 
 
 
1424 aa  178  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  43.68 
 
 
907 aa  177  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  27.98 
 
 
1628 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  30.34 
 
 
2836 aa  174  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  36.17 
 
 
595 aa  174  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  47.29 
 
 
768 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  29.5 
 
 
1213 aa  173  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  27.47 
 
 
14829 aa  172  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.93 
 
 
2245 aa  172  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.81 
 
 
980 aa  168  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  43.32 
 
 
820 aa  167  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  35.52 
 
 
851 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.41 
 
 
4798 aa  166  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  38.99 
 
 
526 aa  165  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.9 
 
 
3598 aa  165  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  28.54 
 
 
1582 aa  164  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  27.52 
 
 
1895 aa  164  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.63 
 
 
2689 aa  161  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.26 
 
 
833 aa  161  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  29.67 
 
 
1217 aa  160  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52.51 
 
 
1029 aa  160  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  52.51 
 
 
1029 aa  160  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  34.85 
 
 
2950 aa  159  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.53 
 
 
2107 aa  156  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.75 
 
 
1480 aa  153  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  51.97 
 
 
2461 aa  153  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  35.84 
 
 
833 aa  152  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  48.16 
 
 
395 aa  151  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  52.27 
 
 
1019 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  47.76 
 
 
395 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  25.99 
 
 
15831 aa  149  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  39.76 
 
 
1610 aa  148  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.52 
 
 
2105 aa  147  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  27.91 
 
 
1072 aa  147  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  49.08 
 
 
1838 aa  146  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  32.53 
 
 
1421 aa  146  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  31.29 
 
 
613 aa  145  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.29 
 
 
2678 aa  143  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  44.87 
 
 
491 aa  142  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  38.51 
 
 
1164 aa  141  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  33.68 
 
 
589 aa  140  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  32.98 
 
 
556 aa  140  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
462 aa  140  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.45 
 
 
3427 aa  140  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  53.41 
 
 
1055 aa  140  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  32.17 
 
 
855 aa  139  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  41.49 
 
 
503 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  33.4 
 
 
9867 aa  136  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  36.77 
 
 
1287 aa  136  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.74 
 
 
1180 aa  135  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  41.49 
 
 
503 aa  135  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  28.8 
 
 
1390 aa  135  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  47.62 
 
 
727 aa  134  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  35.52 
 
 
393 aa  134  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  37.28 
 
 
460 aa  133  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.86 
 
 
1236 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  33.27 
 
 
1112 aa  132  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  33.76 
 
 
2667 aa  132  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  41.87 
 
 
363 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  44.87 
 
 
615 aa  131  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  34.02 
 
 
518 aa  130  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  38.91 
 
 
1610 aa  129  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  44.7 
 
 
475 aa  128  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>