13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1858 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1858  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  397  1e-110  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  2.75455e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3379  hypothetical protein  52.75 
 
 
152 aa  77.4  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0287  hypothetical protein  51.85 
 
 
138 aa  67.4  1e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2996  hypothetical protein  64.41 
 
 
120 aa  63.2  3e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2313  hypothetical protein  48.68 
 
 
122 aa  55.5  6e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2373  hypothetical protein  57.45 
 
 
142 aa  50.1  2e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3345  hypothetical protein  56.86 
 
 
108 aa  49.7  4e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  29.93 
 
 
1218 aa  48.1  9e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0065  hypothetical protein  34.72 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2163  RNA-binding protein  27.59 
 
 
59 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3525  hypothetical protein  80 
 
 
105 aa  45.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0547  hypothetical protein  34.38 
 
 
122 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1176  hypothetical protein  57.69 
 
 
127 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>