More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1832 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  64.85 
 
 		 560 aa  752    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  56.19 
 
 		 564 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 543 aa  1109    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1360  putative PAS/PAC sensor protein  46.74 
 
 		 536 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  27.39 
 
 		 410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1789  response regulator receiver protein  59.52 
 
 		 142 aa  156  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  25.05 
 
 		 557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.2 
 
 		 684 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.68 
 
 		 1355 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  26.37 
 
 		 642 aa  124  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  28.74 
 
 		 1100 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  23.26 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  31.58 
 
 		 965 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  24.53 
 
 		 536 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  23.53 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  26.01 
 
 		 637 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  39.16 
 
 		 438 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  25.82 
 
 		 409 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  27.73 
 
 		 366 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  26.01 
 
 		 642 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  33.95 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  30.88 
 
 		 429 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  23.9 
 
 		 775 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  24.37 
 
 		 516 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  26.79 
 
 		 1083 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 452 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  24.82 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 1465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  39.35 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  39.87 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  25.09 
 
 		 649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 189 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  35.06 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.01 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  30.67 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.35 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  24.62 
 
 		 754 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 262 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  38.41 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  34.42 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  38.41 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  38.41 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  34.42 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  34.42 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  38.41 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  34.42 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  38.41 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  34.42 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  38.13 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  39.35 
 
 		 451 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  34.42 
 
 		 518 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  34.46 
 
 		 476 aa  107  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  31.09 
 
 		 187 aa  106  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  38.41 
 
 		 481 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.07 
 
 		 384 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  24.58 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  23.22 
 
 		 853 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  36.69 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.1 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  35.37 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  42.75 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.1 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  24.11 
 
 		 637 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  27 
 
 		 1082 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  25.67 
 
 		 1087 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.77 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  26.6 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  25.99 
 
 		 846 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  26.77 
 
 		 687 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  27.13 
 
 		 631 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  36.77 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.41 
 
 		 317 aa  103  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  36.77 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.16 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 806 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  25.67 
 
 		 1087 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0346  protein serine/threonine phosphatase  28.8 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 		 823 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.05 
 
 		 706 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.5 
 
 		 629 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3800  response regulator receiver domain-containing protein  38.3 
 
 		 488 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36 
 
 		 994 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  23.57 
 
 		 1079 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  24.9 
 
 		 362 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  40.16 
 
 		 557 aa  99.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  37.59 
 
 		 151 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3245  sigma 54-dependent DNA-binding response regulator  42.34 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  28.69 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  25.73 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.2 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.85 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0430  response regulator receiver protein  33.54 
 
 		 423 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  27.2 
 
 		 885 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2645  response regulator  36 
 
 		 447 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0366662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  36.43 
 
 		 154 aa  97.4  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  25.63 
 
 		 360 aa  97.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>