More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1798 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 168 aa  339  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  67.26 
 
 		 168 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  60.95 
 
 		 169 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  59.88 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  57.59 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  54.72 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  55.41 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 193 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 191 aa  87.8  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  38.67 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  84  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  36.54 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  37.28 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  31.9 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  35.57 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  30.12 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  32.68 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  36.23 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.52 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  28.9 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  33.16 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.34 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  34.92 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  34.06 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  35.44 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  34.46 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.37 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  32.03 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  34.15 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  29.66 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  39.72 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>