More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1796 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  77.63 
 
 		 465 aa  746    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  72.9 
 
 		 465 aa  701    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 465 aa  938    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  70.05 
 
 		 435 aa  627  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  68.4 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  61.08 
 
 		 466 aa  599  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  60.3 
 
 		 466 aa  570  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  39.95 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.16 
 
 		 1694 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 468 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1276 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 562 aa  170  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 4489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 878 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 927 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.18 
 
 		 810 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 4079 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 955 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.64 
 
 		 707 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.05 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 711 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.04 
 
 		 573 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.3 
 
 		 1979 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1094 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 685 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.92 
 
 		 730 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1676 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 1192 aa  136  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.74 
 
 		 1007 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 620 aa  136  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.29 
 
 		 620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 617 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 681 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 3035 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.42 
 
 		 576 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  29.45 
 
 		 635 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 3560 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.38 
 
 		 988 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.34 
 
 		 818 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.56 
 
 		 1056 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.67 
 
 		 816 aa  123  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 740 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1049 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 761 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1138 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1276 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 		 2240 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.87 
 
 		 564 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 602 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1069 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.12 
 
 		 784 aa  120  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.43 
 
 		 764 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 784 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 909 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.82 
 
 		 632 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21 
 
 		 1737 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 615 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.62 
 
 		 1013 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 935 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.14 
 
 		 936 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.93 
 
 		 725 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.26 
 
 		 626 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.53 
 
 		 1022 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.47 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 612 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 3301 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 3172 aa  113  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 		 605 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.38 
 
 		 622 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.74 
 
 		 714 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 637 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.15 
 
 		 745 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  21.72 
 
 		 1067 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 635 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 635 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 636 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.37 
 
 		 626 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 		 1056 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 3145 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.28 
 
 		 689 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 614 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.91 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>