More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1795 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  64.84 
 
 		 628 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  71.66 
 
 		 627 aa  925    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 619 aa  1274    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  64.45 
 
 		 616 aa  823    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  64.49 
 
 		 628 aa  852    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  73.16 
 
 		 629 aa  925    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  71.45 
 
 		 631 aa  919    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  50.81 
 
 		 615 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  42.26 
 
 		 596 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  43.5 
 
 		 607 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  42.72 
 
 		 624 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  40.26 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  41 
 
 		 597 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  39.81 
 
 		 602 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  39.67 
 
 		 598 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  40.96 
 
 		 596 aa  465  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  40.69 
 
 		 598 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  41.86 
 
 		 588 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 		 613 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  42.17 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  41.8 
 
 		 604 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  39.05 
 
 		 620 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  39.05 
 
 		 620 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  39.18 
 
 		 625 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  39.87 
 
 		 596 aa  438  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  40.2 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 615 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  37.7 
 
 		 615 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  39.06 
 
 		 649 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  39.39 
 
 		 685 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  38.99 
 
 		 638 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.33 
 
 		 591 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 617 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  40.38 
 
 		 614 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 594 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  40.58 
 
 		 622 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  39.4 
 
 		 593 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.67 
 
 		 671 aa  425  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 617 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.62 
 
 		 641 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 		 607 aa  419  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.05 
 
 		 607 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 594 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 		 594 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 594 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 		 596 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  37.77 
 
 		 653 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 		 594 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  40.53 
 
 		 624 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  37.34 
 
 		 628 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  39.04 
 
 		 658 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  39.15 
 
 		 607 aa  415  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.43 
 
 		 610 aa  415  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 593 aa  411  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  39.53 
 
 		 666 aa  412  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 599 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  37.92 
 
 		 613 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.42 
 
 		 590 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  37.96 
 
 		 646 aa  405  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  40.59 
 
 		 613 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  36.98 
 
 		 616 aa  404  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.93 
 
 		 627 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 		 613 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.72 
 
 		 708 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.19 
 
 		 607 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 656 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  37.16 
 
 		 665 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 		 640 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 		 622 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  38.32 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 		 625 aa  402  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  37.95 
 
 		 679 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  37.1 
 
 		 640 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  37.76 
 
 		 644 aa  396  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  40.64 
 
 		 612 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  38.03 
 
 		 692 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.31 
 
 		 599 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 		 678 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  37.89 
 
 		 616 aa  399  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  37.33 
 
 		 669 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  38.29 
 
 		 676 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  38.29 
 
 		 676 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  36.27 
 
 		 595 aa  399  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 		 641 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 		 665 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  38.29 
 
 		 676 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.82 
 
 		 613 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 		 643 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  38.98 
 
 		 643 aa  395  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  37.9 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 610 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  38.91 
 
 		 690 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  37.23 
 
 		 678 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  37.09 
 
 		 594 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.83 
 
 		 611 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>