More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1788 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1788  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
308 aa  623  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  2.40723e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0719  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.85 
 
 
308 aa  501  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.778436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2055  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.1 
 
 
311 aa  491  1e-138  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545936  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1334  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  72.96 
 
 
311 aa  474  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0492  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  75.84 
 
 
301 aa  467  1e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0142904  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.24 
 
 
349 aa  427  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00166566  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1646  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.03 
 
 
312 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108455  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.32 
 
 
307 aa  304  1e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.84 
 
 
306 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  50.81 
 
 
320 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  48.86 
 
 
311 aa  293  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  48.52 
 
 
307 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  1.32392e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.02 
 
 
308 aa  288  6e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
312 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.04 
 
 
310 aa  288  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.71 
 
 
313 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.74 
 
 
312 aa  287  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  47.35 
 
 
309 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.21 
 
 
307 aa  285  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  49.51 
 
 
305 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  48.84 
 
 
312 aa  284  1e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  3.14766e-08 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
313 aa  284  1e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  47.84 
 
 
315 aa  281  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  48.22 
 
 
309 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.72 
 
 
304 aa  278  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.4 
 
 
311 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  46.77 
 
 
313 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.36 
 
 
308 aa  275  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  46.25 
 
 
312 aa  274  2e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.6 
 
 
315 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.25 
 
 
307 aa  273  4e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  46.1 
 
 
306 aa  271  8e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.57 
 
 
313 aa  271  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0327  aspartate carbamoyltransferase  47.37 
 
 
312 aa  271  9e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1475  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.75 
 
 
310 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0541  aspartate carbamoyltransferase  46.1 
 
 
306 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000499557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.05 
 
 
312 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  47.7 
 
 
320 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.08 
 
 
311 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.21 
 
 
328 aa  268  6e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.6 
 
 
315 aa  268  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
313 aa  267  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.66 
 
 
310 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.66 
 
 
310 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  46.58 
 
 
312 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.37 
 
 
318 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.08 
 
 
323 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.85 
 
 
312 aa  265  6e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.6 
 
 
328 aa  265  6e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  49.63 
 
 
313 aa  265  9e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.06 
 
 
317 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  50.74 
 
 
311 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.66 
 
 
318 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.1 
 
 
316 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  46.05 
 
 
319 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.5 
 
 
328 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
309 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.15 
 
 
319 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.04 
 
 
318 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0924  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
344 aa  262  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  46.13 
 
 
314 aa  261  7e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  46.2 
 
 
329 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
317 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  45.6 
 
 
306 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.59 
 
 
308 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  44.16 
 
 
313 aa  260  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2039  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.58 
 
 
309 aa  260  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.485925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.89 
 
 
313 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0155  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.58 
 
 
309 aa  260  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.08 
 
 
308 aa  259  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  47.27 
 
 
310 aa  259  5e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.08 
 
 
316 aa  258  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.48 
 
 
313 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.75 
 
 
318 aa  258  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.06 
 
 
316 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.27 
 
 
308 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.06 
 
 
316 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  47.41 
 
 
309 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  45.02 
 
 
302 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
324 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.16 
 
 
313 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  46.58 
 
 
332 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.86 
 
 
334 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  45.86 
 
 
334 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.89 
 
 
323 aa  255  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.26 
 
 
336 aa  255  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.83 
 
 
313 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  46.71 
 
 
319 aa  255  8e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  44.88 
 
 
310 aa  254  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0839  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.65 
 
 
321 aa  254  1e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111278  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  45.43 
 
 
318 aa  254  1e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.08 
 
 
334 aa  254  1e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.1 
 
 
315 aa  254  2e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.7 
 
 
305 aa  253  2e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.73 
 
 
316 aa  253  4e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.55 
 
 
315 aa  253  4e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.55 
 
 
315 aa  253  4e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.71 
 
 
334 aa  252  5e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.51 
 
 
335 aa  252  5e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  45.54 
 
 
316 aa  252  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>