More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1752 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  66.82 
 
 		 227 aa  284  9e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  63.21 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  59.62 
 
 		 213 aa  258  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  59.15 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.1 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  32.69 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 		 225 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  30.66 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  36.24 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  33.67 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.71 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  32.91 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  32.91 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  32.71 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  32.91 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  34.72 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  33.03 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  32.91 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.49 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 		 223 aa  104  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  31.62 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.62 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  31.62 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  32.05 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  34.26 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  35.51 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  31.92 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  32.18 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.22 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 232 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 232 aa  101  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  30.84 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 232 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  31.68 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  31.02 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.38 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  31.13 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  32.35 
 
 		 291 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.88 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  34.1 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.11 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.76 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.46 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0907  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.02 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464753  normal  0.0304334 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  32.12 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.02 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0569787 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  31.94 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  31.86 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  30 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  31.05 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  29.58 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  27.23 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  31.92 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  31.68 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.42 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  31.11 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.62 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.68 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  26.51 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.48 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.39 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.1 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.53 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  29.77 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>