More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1725 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
372 aa  773    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  64.53 
 
 
375 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  59.84 
 
 
375 aa  480  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.2 
 
 
374 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  51.84 
 
 
354 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.42 
 
 
354 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.92 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.19 
 
 
354 aa  342  8e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.53 
 
 
354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  47.88 
 
 
365 aa  338  9e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.02 
 
 
353 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.86 
 
 
351 aa  332  6e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.86 
 
 
351 aa  332  8e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.17 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.54 
 
 
355 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.48 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.29 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.82 
 
 
357 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.11 
 
 
341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.46 
 
 
353 aa  305  6e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.21 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.63 
 
 
354 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.38 
 
 
356 aa  296  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  39.06 
 
 
363 aa  295  9e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.76 
 
 
357 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.48 
 
 
355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.94 
 
 
547 aa  287  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.07 
 
 
354 aa  285  7e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  38.07 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.5 
 
 
354 aa  280  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  44.44 
 
 
358 aa  278  9e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.4 
 
 
355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.94 
 
 
376 aa  269  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.36 
 
 
385 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.36 
 
 
385 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  35.16 
 
 
380 aa  262  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.43 
 
 
354 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.43 
 
 
379 aa  259  6e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.64 
 
 
362 aa  258  9e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.14 
 
 
387 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.52 
 
 
395 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.98 
 
 
352 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  36 
 
 
383 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.23 
 
 
348 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.76 
 
 
390 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.06 
 
 
360 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.59 
 
 
353 aa  242  6e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.84 
 
 
352 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.13 
 
 
352 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  34.62 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  36.44 
 
 
354 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  36.44 
 
 
354 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  37.24 
 
 
354 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.51 
 
 
381 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.51 
 
 
381 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.21 
 
 
368 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.7 
 
 
374 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.52 
 
 
381 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.35 
 
 
332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.12 
 
 
357 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.81 
 
 
382 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.29 
 
 
351 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.07 
 
 
333 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.7 
 
 
325 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.63 
 
 
327 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.1 
 
 
325 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.21 
 
 
360 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
339 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.68 
 
 
355 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.43 
 
 
339 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.27 
 
 
327 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.12 
 
 
372 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 
387 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.93 
 
 
316 aa  189  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.15 
 
 
316 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.38 
 
 
321 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.56 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.04 
 
 
357 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.29 
 
 
316 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
320 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.29 
 
 
316 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
316 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
316 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  33.33 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  33.33 
 
 
320 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  33.33 
 
 
316 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 
325 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.08 
 
 
322 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 
325 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 
325 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.67 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.89 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  30.67 
 
 
322 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.14 
 
 
291 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.37 
 
 
321 aa  156  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.22 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  34.52 
 
 
321 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.97 
 
 
324 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>