16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1695 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1695  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1876  hypothetical protein  66.67 
 
 
245 aa  358  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1084  hypothetical protein  64.49 
 
 
245 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1491  hypothetical protein  61.14 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1586  hypothetical protein  56.05 
 
 
246 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0196619  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0850  hypothetical protein  52.67 
 
 
246 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00832469  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1428  hypothetical protein  50.61 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1734  hypothetical protein  29.44 
 
 
273 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825048  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2097  hypothetical protein  29.36 
 
 
321 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1581  hypothetical protein  26.43 
 
 
274 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.518967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1899  hypothetical protein  25.43 
 
 
294 aa  92  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201368  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0059  hypothetical protein  25.11 
 
 
268 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0434  hypothetical protein  26.92 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1927  hypothetical protein  26.72 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000210068  hitchhiker  0.00302398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2380  hypothetical protein  23.21 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980429  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1650  hypothetical protein  23.81 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00134498  normal  0.369748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>