102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1686 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1867  major facilitator transporter  78.29 
 
 
436 aa  657  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  73.5 
 
 
441 aa  651  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  78.32 
 
 
437 aa  654  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  77.16 
 
 
437 aa  656  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1686  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
454 aa  897  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000674894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  68.96 
 
 
438 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  64.02 
 
 
438 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  35.14 
 
 
441 aa  222  1e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  29.93 
 
 
427 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  25.5 
 
 
642 aa  110  7e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57608  predicted protein  25.73 
 
 
474 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.371537 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01489  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04850)  23.45 
 
 
533 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0186505  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
457 aa  63.5  7e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
404 aa  56.6  1e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  41.56 
 
 
1065 aa  51.2  4e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  25.61 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  24.86 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  31.14 
 
 
465 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.72 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  39.08 
 
 
455 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  31.78 
 
 
472 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  27.04 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
454 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  27.27 
 
 
544 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  24.85 
 
 
407 aa  46.6  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  39.78 
 
 
459 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  39.08 
 
 
455 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  26.8 
 
 
456 aa  46.6  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  26.8 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  26.8 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  32.93 
 
 
467 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  31.29 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  36.17 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  27.71 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  4.30598e-05 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
587 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  37.18 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  2.0202e-12 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
472 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  34.62 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  34.07 
 
 
433 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  25.72 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.79 
 
 
513 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  24.46 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  38.03 
 
 
485 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  32.1 
 
 
465 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 
607 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.33 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  36.04 
 
 
452 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  24.46 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  35.14 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  34.19 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  36.62 
 
 
477 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  30.4 
 
 
451 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  33.71 
 
 
464 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  24.1 
 
 
410 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  33.67 
 
 
474 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.0213e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.47 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.07671e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  24.77 
 
 
395 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.47 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  24.77 
 
 
385 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.67 
 
 
473 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.47 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.14385e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  33.67 
 
 
474 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  32.43 
 
 
473 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.09346e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  24.77 
 
 
395 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  39.47 
 
 
513 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  6.25397e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 
626 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.47 
 
 
513 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  24.73 
 
 
410 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  31.62 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  39.47 
 
 
513 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  24.54 
 
 
395 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 
435 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  24.51 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  24.51 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 
520 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  24.51 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.19 
 
 
402 aa  43.5  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35485e-06 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  34.69 
 
 
476 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  32.73 
 
 
467 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  24.51 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
388 aa  43.5  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  4.60218e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  24.51 
 
 
454 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  34.09 
 
 
464 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  32.17 
 
 
464 aa  43.5  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.76 
 
 
474 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 
485 aa  43.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.43 
 
 
478 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.43 
 
 
478 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.43 
 
 
478 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.43 
 
 
478 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.43 
 
 
478 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
409 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>