More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1680 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1680  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 167 aa  343  5e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  67.95 
 
 		 168 aa  230  9e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  68.99 
 
 		 171 aa  227  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  68.42 
 
 		 164 aa  224  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  69.08 
 
 		 166 aa  221  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  64.52 
 
 		 164 aa  217  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1982  ferric uptake regulator family protein  57.62 
 
 		 165 aa  180  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  37.96 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  37.32 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  37.31 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  36.88 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.97 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08771  putative iron storage-related regulatory protein  30.77 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.139976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2222  ferric uptake regulator family protein  32 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  29.55 
 
 		 143 aa  89  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  35.82 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  31.16 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  29.23 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0247  ferric uptake regulator, Fur family  28 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  31.94 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  31.47 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  30.34 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  29.41 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  29.41 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  29.41 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  31.16 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  26.92 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  30.22 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  31.16 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  31.16 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  30.22 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.07 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  30.22 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  30.22 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  26.32 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  31.75 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  29.66 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  31.62 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  25.56 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  25.56 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  28 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  29.85 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  28 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  28.97 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  33.83 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  27.01 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  31.43 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  29.2 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  27.46 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  33.78 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  27.61 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2968  ferric uptake regulator family protein  32.41 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2142  putative ferric uptake regulation protein  33.06 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0418  ferric-uptake regulator  28.79 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00383086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  30.15 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  29.37 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1958  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0491085  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  28.15 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  26.19 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1334  ferric uptake regulator family protein  30.33 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  30.37 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  27.78 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  33.58 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  29.66 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  28.57 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0396  ferric uptake regulator, Fur family  27.89 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  25.87 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  26.32 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>