33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1660 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  2.95507e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  58.65 
 
 
237 aa  297  9e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  58.44 
 
 
237 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  36.91 
 
 
249 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.91 
 
 
249 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.22 
 
 
260 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.75 
 
 
248 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  31.74 
 
 
251 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  31.84 
 
 
243 aa  127  1e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  37.62 
 
 
250 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  31.6 
 
 
246 aa  118  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  27.56 
 
 
259 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  28.57 
 
 
261 aa  92  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  37.98 
 
 
248 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  29.53 
 
 
246 aa  88.6  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  27.73 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  36.57 
 
 
248 aa  82.4  5e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3276  hypothetical protein  41.05 
 
 
102 aa  77.4  2e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  26.8 
 
 
257 aa  64.3  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  25.95 
 
 
256 aa  57.8  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.69 
 
 
252 aa  58.2  1e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  25.95 
 
 
256 aa  57.8  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0412  hypothetical protein  31.03 
 
 
241 aa  57  3e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14301  hypothetical protein  28.12 
 
 
245 aa  55.8  6e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.47 
 
 
252 aa  55.5  7e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01301  hypothetical protein  22.5 
 
 
256 aa  54.7  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  28.38 
 
 
253 aa  52.8  4e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  2.61911e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4381  hypothetical protein  26.28 
 
 
260 aa  52.4  6e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0730  hypothetical protein  25.95 
 
 
261 aa  52.4  6e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3559  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.76 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4385  hypothetical protein  24.05 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.016831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3421  hypothetical protein  23.53 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2682  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.53 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>