More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1605 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  72.13 
 
 		 1221 aa  1796    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1218 aa  2504    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  36.95 
 
 		 1345 aa  731    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  37.65 
 
 		 1292 aa  759    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  79.15 
 
 		 1218 aa  1991    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  65.26 
 
 		 1212 aa  1610    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 		 1364 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  37.43 
 
 		 1279 aa  761    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  36.4 
 
 		 1342 aa  743    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  37.48 
 
 		 1307 aa  761    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  39.08 
 
 		 1277 aa  808    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.53 
 
 		 1371 aa  725    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  37.22 
 
 		 1291 aa  746    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  36.6 
 
 		 1324 aa  746    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.35 
 
 		 1286 aa  787    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.42 
 
 		 1259 aa  786    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.31 
 
 		 1227 aa  1620    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  36.48 
 
 		 1342 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  69.36 
 
 		 1202 aa  1727    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  79.1 
 
 		 1210 aa  1974    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  36.83 
 
 		 1345 aa  740    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  75.6 
 
 		 1217 aa  1896    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  76.5 
 
 		 1214 aa  1915    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  39.08 
 
 		 1277 aa  808    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.15 
 
 		 1309 aa  763    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.77 
 
 		 1304 aa  754    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  36.4 
 
 		 1342 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  36.55 
 
 		 1359 aa  736    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.48 
 
 		 1307 aa  760    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  65.2 
 
 		 1213 aa  1609    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  36.48 
 
 		 1342 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  36.65 
 
 		 1307 aa  730    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  37.16 
 
 		 1308 aa  745    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  37.71 
 
 		 1271 aa  798    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  36.19 
 
 		 1300 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.27 
 
 		 1289 aa  776    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  35.82 
 
 		 1349 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  36.4 
 
 		 1342 aa  743    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 		 1292 aa  730    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  37.12 
 
 		 1324 aa  757    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.83 
 
 		 1279 aa  773    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.5 
 
 		 1292 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  36.4 
 
 		 1342 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.89 
 
 		 1265 aa  712    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  36.4 
 
 		 1342 aa  743    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.77 
 
 		 1288 aa  781    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  65.17 
 
 		 1212 aa  1609    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  38.5 
 
 		 1280 aa  832    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 		 1304 aa  750    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  36.83 
 
 		 1345 aa  740    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.41 
 
 		 1282 aa  776    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  34 
 
 		 1188 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  33.95 
 
 		 1183 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 		 1183 aa  586  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 		 1204 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.14 
 
 		 1187 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.63 
 
 		 1197 aa  556  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 		 1340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  38.2 
 
 		 1308 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  37.36 
 
 		 1341 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.36 
 
 		 1341 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.24 
 
 		 1340 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.36 
 
 		 1341 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.18 
 
 		 1344 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  36.87 
 
 		 1341 aa  399  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  29.36 
 
 		 459 aa  149  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  28.14 
 
 		 459 aa  145  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  29.3 
 
 		 459 aa  141  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  28.37 
 
 		 466 aa  140  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 		 459 aa  140  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  28.76 
 
 		 499 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  28.22 
 
 		 499 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  27.79 
 
 		 499 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  28.54 
 
 		 499 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.66 
 
 		 485 aa  129  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  29.85 
 
 		 503 aa  129  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.54 
 
 		 469 aa  128  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.12 
 
 		 481 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  28.91 
 
 		 503 aa  126  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  27.43 
 
 		 481 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 		 459 aa  126  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.68 
 
 		 460 aa  125  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.58 
 
 		 500 aa  125  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  28.23 
 
 		 499 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  26.76 
 
 		 485 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  28.23 
 
 		 499 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  27.94 
 
 		 499 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  24.52 
 
 		 472 aa  121  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.03 
 
 		 497 aa  121  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  29.43 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  28.98 
 
 		 499 aa  119  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  26.54 
 
 		 461 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.36 
 
 		 493 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  28.64 
 
 		 499 aa  119  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.71 
 
 		 497 aa  118  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.7 
 
 		 501 aa  118  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  26.59 
 
 		 497 aa  118  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.9 
 
 		 501 aa  118  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25 
 
 		 459 aa  118  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.71 
 
 		 497 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>