More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1584 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  76.71 
 
 		 434 aa  672    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  73.84 
 
 		 435 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 434 aa  888    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  77.42 
 
 		 434 aa  690    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  71.46 
 
 		 431 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  68.93 
 
 		 433 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  71.03 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  55.64 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  47.96 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  51.63 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  45.66 
 
 		 401 aa  349  5e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  44.61 
 
 		 409 aa  339  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  53.8 
 
 		 407 aa  325  8.000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  46.74 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  48.79 
 
 		 411 aa  320  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  47.49 
 
 		 396 aa  316  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.61 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.45 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  50.28 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  50.28 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  50.28 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  48.07 
 
 		 392 aa  310  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.69 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.69 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  42.69 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  43.86 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  42.65 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.08 
 
 		 413 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  44.22 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  42.45 
 
 		 489 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  42.14 
 
 		 419 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  44.58 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  51.71 
 
 		 396 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  43.5 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  48.59 
 
 		 392 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  48.59 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  48.59 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  42.68 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.7 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  48.59 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  48.59 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  50 
 
 		 421 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  48.59 
 
 		 387 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  47.22 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.29 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  48.08 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  48.02 
 
 		 392 aa  295  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  42.59 
 
 		 439 aa  295  7e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  45.82 
 
 		 421 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  48.31 
 
 		 387 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  48.9 
 
 		 501 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  51.09 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  50.47 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  40.91 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  43.07 
 
 		 432 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  44.08 
 
 		 432 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.9 
 
 		 419 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  50.78 
 
 		 396 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.72 
 
 		 436 aa  292  8e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  41.67 
 
 		 441 aa  292  8e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  50.78 
 
 		 395 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  50.78 
 
 		 395 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  49.3 
 
 		 512 aa  292  9e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  46.61 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  50.31 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  50.31 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  50.78 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.96 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  42.13 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  41.15 
 
 		 419 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  43.83 
 
 		 435 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  43.7 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  44.58 
 
 		 482 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  41.86 
 
 		 454 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  43.48 
 
 		 502 aa  289  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.12 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0658  GTP-binding protein HflX  41.81 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.09 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  42.75 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  42.75 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  42.75 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  49.06 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  42.75 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  42.75 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.65 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.9 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  42.12 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.9 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  41.92 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  42.12 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  42.12 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  42.12 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  42.12 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  42.12 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  47.09 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  42.12 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  42.12 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.9 
 
 		 419 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  41.48 
 
 		 420 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>