More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1544 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  71.35 
 
 
192 aa  271  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  66.1 
 
 
265 aa  255  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  63.69 
 
 
182 aa  253  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  60.11 
 
 
177 aa  227  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 
188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
188 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 
181 aa  143  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
188 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
190 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
192 aa  124  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
187 aa  108  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
166 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
208 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
177 aa  84.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
211 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
228 aa  79  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  30 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  28.73 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  32.28 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  28.49 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  31.41 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  29.65 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  36.64 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  25.28 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  28.75 
 
 
195 aa  70.9  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  28.26 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  30.77 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.05 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  31.25 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  27.65 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>