More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1509 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  76.66 
 
 		 287 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  62.86 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  61.4 
 
 		 280 aa  338  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  26.46 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 314 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 340 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 361 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.09 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  24.82 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.47 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 323 aa  92  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.24 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  24.73 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  27.07 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  27 
 
 		 348 aa  90.5  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  24.38 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  27.57 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  26.97 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 474 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  27.44 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 397 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  27.73 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  26.09 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.94 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  27.54 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  25.36 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  25.36 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.09 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  25.36 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  25.36 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  25.36 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.28 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 		 303 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.45 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  23.78 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.48 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>