299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1473 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  73.58 
 
 		 193 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  65.28 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  71.26 
 
 		 180 aa  245  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  59.59 
 
 		 193 aa  240  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  58.38 
 
 		 194 aa  204  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  44.83 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  45.14 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  36.17 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  37.22 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  40.59 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  38.12 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  37.84 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  34.95 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  39.39 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  38.37 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  32.74 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  32.74 
 
 		 205 aa  93.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  33.93 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  33.93 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  32.14 
 
 		 265 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  31.55 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  30.95 
 
 		 220 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  32.74 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  30.21 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  30.59 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  30.59 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  28.42 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  27.43 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  27.43 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  28.82 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  26.44 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  26.86 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.76 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  26.29 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  26.86 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.63 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  27.87 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  32.61 
 
 		 881 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  25.82 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  28.96 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  25.28 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.54 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  26.77 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  31.1 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.56 
 
 		 381 aa  58.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  25.54 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  29.45 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  22.78 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  26.51 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  26.03 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  32.81 
 
 		 976 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  29.7 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  28.99 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.03 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  26 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.78 
 
 		 739 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 		 349 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  29.17 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.78 
 
 		 739 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.78 
 
 		 739 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  31.45 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  25.68 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  23.88 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  25.38 
 
 		 333 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  29.21 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  32.54 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  28.12 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  29.28 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  26.35 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  29.19 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  28.05 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  28.05 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  29.19 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  29.19 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  29.19 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  25.16 
 
 		 332 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  25.79 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  28.46 
 
 		 343 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  28.46 
 
 		 343 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 		 359 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  22.44 
 
 		 367 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  22.44 
 
 		 367 aa  52  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  29.53 
 
 		 366 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  26.28 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>